2017年9月10日
高通量测序中，reads、contigs、scaffold之间的联系
摘要： read：测序时，产生的较短的原始序列叫read contigs：有多个reads通过片段的重叠，组装成一个更大的read，称为contigs scaffold：多个contigs通过片段的重叠拼接成更长的scaffold； 从上面的解释来看，可以发现这些命名应该比价常出现在de novo拼接当中。 阅读全文
posted @ 2017-09-10 16:41 遗世独立的愚公 阅读(1357) 评论(0) 推荐(0)
转录组中 实验设计 的相关问题
摘要： 1.单端测序还是双端测序 2.测序的读长是多少 3.是否建立链特异性库 4.需要多少的测序数据量（即测序深度是多少） 5.设置多少个生物学重复比较好 6.如果我们做了生物学重复还要做技术重复吗？ 相关答案： 至少需要三个重复 测序深度对结果的改善不如增加生物学重复 阅读全文
posted @ 2017-09-10 13:10 遗世独立的愚公 阅读(402) 评论(0) 推荐(0)