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输出结果： [(23, 27), (55, 59), (70, 74), (78, 82)] 阅读全文
posted @ 2017-12-11 17:06
遗世独立的愚公
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seq=['A', 'C', 'G', 'T', 'S'] 计算出seq中两两排列组合，并以列表的方式排列。 阅读全文
posted @ 2017-12-11 16:07
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DNA序列： ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCAATCGGTCGAATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGATCGGTCGAGCGTGTTTCAAAGTTTGCGCCTAG 内含子1：ATCGGTCGAA 内含子2：ATCGGTCGAGCGTGT 剪切之后的 阅读全文
posted @ 2017-12-11 15:33
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#!/usr/bin/python #-*- coding:utf-8 -*- "处理fasta文件，将ID号和序列放在一行" import sys with open(sys.argv[1]) as f: fw=open('out.fasta', 'w') line=f.read() line=line.replace('\n', '').replace('>', '\... 阅读全文
posted @ 2017-12-11 15:13
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def translate_rna(sequence): # 密码子表 codonTable = { 'AUA': 'I', 'AUC': 'I', 'AUU': 'I', 'AUG': 'M', 'ACA': 'T', 'ACC': 'T', 'ACG': 'T', 'ACU': 'T', 'AAC': 'N' 阅读全文
posted @ 2017-12-11 15:08
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"计算数组中最小的两个数的和" #!usr/bin/python3 #-*- coding:utf-8 -*- numbers=np.array((4,3,7,5,6)) def sum_two_smallest_numbers(numbers): numbers.sort() return numbers[0]+numbers[1] 阅读全文
posted @ 2017-12-11 15:07
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用法： python3 proweight.py filename 阅读全文
posted @ 2017-12-11 15:05
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思路：寻找序列两个序列的差异 阅读全文
posted @ 2017-12-11 14:39
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在匹配模式中?可以查找重叠区域。 ###上述的结果为 (2,5) (4,7) (10,13) ###假如不用？ 输出结果为： (2,5) (10,13) 从上述结果可以看出，重叠的区域无法查找出来，我也不晓得为啥？？？？ 阅读全文
posted @ 2017-12-11 14:37
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#!/usr/bin/python #-*- coding:utf-8 -*- from Bio import SeqIO def fq2fa(my_file): with open(my_file) as handle: record=SeqIO.parse(handle, "fastq") SeqIO.write(record, "./... 阅读全文
posted @ 2017-12-11 14:35
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