摘要：
1.在类中，有时需要限制输入的内容，可以用一个set来输入需要的内容，用get来取得输入的内容 2.其实说白，上述所说的方法就是用来检查输入内容，让人们不能随心所欲的设置了。 参见下面的例子： 虽然上面的函数可以检查参数，但是略显复杂。没有直接调用属性的这么简单直接。 有没有既检查参数，又可以用类似 阅读全文
posted @ 2017-09-23 18:00
遗世独立的愚公
阅读(359)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
1.有如下一组数据，经处理，希望得到每行60个碱基，每十个碱基一组。 1.将上述数据复制到编辑器，利用列模式，删除数字。保存为fa格式的文件 2.删除碱基间的空格并将小写变为大写： seqkit seq 11.fa -g -u > 12.fa 3.指定每行输出的碱基数 seqkit seq 12.f 阅读全文
posted @ 2017-09-22 21:13
遗世独立的愚公
阅读(216)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
该软件功能强大，兼容所有系统。 网站：http://bioinf.shenwei.me/seqkit/usage/ 下载，解压，安装seqkit软件，下载二进制文件较好。 一、序列操作： 1.取反向序列 seqkit seq test.fa -r > test_re.fa 2.取互补序列 seqki 阅读全文
posted @ 2017-09-22 20:14
遗世独立的愚公
阅读(7200)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
1.利用Linux命令：awk 2.用法如下： awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' fastq > fasta 3.上述用法注意事项： fastq文件必须是解压格式的，不能是gz后缀的，虽然命令也能 阅读全文
posted @ 2017-09-22 17:10
遗世独立的愚公
阅读(10218)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
数值60代表每行输出60个碱基。（感谢原作者） 执行命令：perl fasta_re.perl srr.fasta > srr_re.fasta 如若执行不了，记得查看pl文件是否有可执行权限。 阅读全文
posted @ 2017-09-22 16:56
遗世独立的愚公
阅读(654)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
为了到达限制的目的，class在定义的时候，允许一个特殊的__slots__变量，来限制该class实例能够添加的属性 使用__slots__要注意，该变量定义的属性仅对当前类实例起作用， 对继承的子类是不起作用的。 阅读全文
posted @ 2017-09-21 20:39
遗世独立的愚公
阅读(366)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
1.Python是动态语言，根据类创建的实例，可以任意绑定属性 2.给实例绑定属性的方法有两种： 通过实例变量或者通过self变量。 如果类本身需要属性，这个属性虽然归类所有，但是类的所有实例都可以访问到。 给实例绑定方法的用法如下： 但是给一个实例绑定的方法，对另一个实例是不起作用。（其实这样有很 阅读全文
posted @ 2017-09-21 20:14
遗世独立的愚公
阅读(158)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
1.了解父类和子类的关系： 在上述三行代码中，Animal是父类，而fish和Tortoise则是Animal的子类。 子类具有父类的全部功能，这种特性称为：继承 此外，从上面的代码可以看出，三个类都有run()方法。当子类和父类拥有相同的方法时，子类的方法会覆盖父类的方法。这中特性称为：多态 从左 阅读全文
posted @ 2017-09-20 20:03
遗世独立的愚公
阅读(167)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
Linux版本：Ubuntu 12 安装过程： ipython notebook现在好像更名为ipython jupyter 1.安装conda，添加环境变量，source 激活 2.conda install jupyter 3运行：ipython notebook 虽然运行ipython not 阅读全文
posted @ 2017-09-20 15:36
遗世独立的愚公
阅读(1065)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
在Python中，所有的数据类型都可以视为对象，自定义的对象数据类型就是面向对象中的类（class）的概念。 面向对象编程：object oriented programming简称OOP. 给对象发消息实际上就是调用对应的关联函数，我们称之为对象的方法（method）。 和普通函数相比，在类中定义 阅读全文
posted @ 2017-09-20 08:58
遗世独立的愚公
阅读(246)
评论(0)
推荐(0)
浙公网安备 33010602011771号