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posted @ 2017-02-09 15:18
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部分方法参考自在家里如何免费使用中国知网？ - 大学生 - 知乎的回答，已注明出处。 知网文献下载：idata中国知网 idata中国知网网址：idata中国知网 https://www.cn-ki.net/ 进入系统，注册账号，普通注册用户，每天自由下载2-5篇(系统自动计算)。（大部分时候一天只 阅读全文
posted @ 2017-02-07 22:03
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摘要：
其他： 我是一名程序员，工作很努力，为什么绩效还总是垫底？ 外企，中年失业何去何从？ 来公司半年了，也悟出了一些道理。 如果我可以给每个工程教育增加一门课，它不会涉及编译器、门电路或是时间复杂度，而是一门介绍行业现实的入门课，因为没人教过这些，所以我们遭受了很多不必要的痛苦和折磨。希望本文可以成为年 阅读全文
posted @ 2017-02-06 11:43
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摘要：
参考： Netcat for Windows Linux Netcat 命令——网络工具中的瑞士军刀 8 个实用的 Linux netcat 命令示例 If I am not mistaken, nc comes as a default tool in most of the Linux distros. You can download the windows port of the ... 阅读全文
posted @ 2017-01-20 23:09
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官网：http://www.try2hack.nl/levels 玩到第五关实在是过不去了，因为那个程序太老了，win7根本就运行不了，崩溃。 转自：http://blog.csdn.net/chinacodec/article/details/4002518 大学时代喜欢玩一些 hack 游戏， 这个是当时尝试著名的 try2hack 时候做得过关纪录 第一关: Passwor... 阅读全文
posted @ 2017-01-20 22:08
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摘要：
转自：http://www.cnblogs.com/fnng/p/3670789.html 多线程和多进程是什么自行google补脑 对于python 多线程的理解，我花了很长时间，搜索的大部份文章都不够通俗易懂。所以，这里力图用简单的例子，让你对多线程有个初步的认识。 单线程 在好些年前的MS-DOS时代，操作系统处理问题都是单任务的，我想做听音乐和看电影两件事儿，那么一定要先排一下... 阅读全文
posted @ 2017-01-20 17:22
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在虚拟机里装一个Linux（centos），有时间可以装个mac玩一下。（使用centos或者Ubuntu时安装软件将会非常方便） ifconfig –a 显示当前Linux主机的 ip 地址 如何让虚拟机在后台运行，之前搞定了，现在又搞不定了！ 如何切换到root权限：su root 安装基本的软件：gcc，python，perl，R之类的 CentOS更改yum源与更新系统（很慢） ... 阅读全文
posted @ 2017-01-20 17:21
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译文：oschina 英文：bt3gl 当涉及到对一些目标网络的侦察时，出发点无疑是首先发现宿主主机。这个任务还可能包含嗅探和解析网络中数据包的能力。 几周前，我曾经谈到了如何使用Wireshark来进行数据包嗅探，但如果你没有wireshark，你如何去监控网络流量呢？ 这一次，Python提供了几种解决方案，今天我将一步步演示如何建立一个UDP主机发现工具。首先，我们要看我们如何处理原... 阅读全文
posted @ 2017-01-20 13:00
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df -h ./ du -hs ./ du -h /ifs4/BC_RD/USER/lizhixin/my_project/human_chr22 | grep [[:digit:]+]G du [-abcDhHklmsSx] [-L ][-X ][--block-size][--exclude=] [--max-depth=][--help][--version][目录或文件] 常用... 阅读全文
posted @ 2017-01-20 12:39
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转自：http://www.cnblogs.com/kaituorensheng/p/4236254.html 正则表达式是一种符号表示法，用于识别文本模式。Linux处理正则表达式的主要程序是grep。grep搜索与正则表达式匹配的行，并将结果输送至标准输出。 1. grep匹配模式 grep按下 阅读全文
posted @ 2017-01-20 12:37
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使用linux系统难免会忘记文件所在的位置，可以使用以下命令对系统中的文件进行搜索。搜索文件的命令为”find“；”locate“；”whereis“；”which“；”type“ linux下最强大的搜索命令为”find“。它的格式为”find “；比如使用find命令搜索在根目录下的所有interfaces文件所在位置，命令格式为”find / -name 'interfaces'“ ... 阅读全文
posted @ 2017-01-19 17:11
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一直都搞不清楚这两者的具体区别。 其实初学者搞不清楚很正常，因为它们的本质是相通的，都是对基因进行归类注释的数据库。 建议初学者自己使用一下这两个数据库，应该很快就能明白其中的区别。 以下以一个案例来详细说明两者的区别： 推荐一个没有任何基础的人都能使用的gene set注释工具 http://ww 阅读全文
posted @ 2017-01-18 17:37
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简介：长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能, 这些机制包括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等。lncRNA通过这些作用机制在不同水平进行基因表达调控。 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA[1]。研究表明, lncRNA... 阅读全文
posted @ 2017-01-18 16:17
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目前从2005年生物信息科研服务开始出现，到现在大概经历了10年，公司会关注生物信息行业目前所处的发展阶段，是否要进行市场细分和行业转型。生信从业者更多的会关心未来个人在生信行业的发展前景，具体待遇如何。 本文借助网络博客新行业的发展，结合自己的认识，浅谈生信行业的发展 作为一个新行业，肯定要经历市场极速且持续膨胀，然后再逐渐萎缩的周期。 第一阶段：刚开始的时候，是由于社会发展产生了... 阅读全文
posted @ 2017-01-18 16:15
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概念 图位克隆(Map - based cloning) 又称定位克隆(positional cloning) , 1986 年首先由剑桥大学的Alan coulson 提出[5 ] ,用该方法分离基因是根据目的基因在染色体上的位置进行的,无需预先知道基因的DNA 顺序,也无需预先知道其表达产物的有关信息,但应有以下两方面的基本情况:一是有一个根据目的基因的有无建立起来的遗传分离群体,如F、D... 阅读全文
posted @ 2017-01-18 14:46
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套路 这通常就是基因组组装后的必做分析，通过比较基因组学的手段进行分析，可以知道所研究物种在进化过程中哪些核心基因家族发生了变化，从而导致了其特殊的适应性机制的形成。 参考： Extremotolerant tardigrade genome and improved radiotolerance of human cultured cells by tardigrade-unique pr... 阅读全文
posted @ 2017-01-17 13:07
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摘要：
附： 如何看懂英文文献？（好） 看需求，分层次 如何总结和整理学术文献？ Mendeley & Everything 如何在pdf文献上做笔记？福晰阅读器 自己感悟： 一篇专业文献通常会有几页到几十页不等，读文献是一个过于笼统的概念。 读文献必须要分为几个不同的程度（需求）： 1.读着玩，了解领域动 阅读全文
posted @ 2017-01-16 19:21
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摘要：
读文献时发现自己逻辑思考能力太差，想起了以前学过的科研的基本思路：观察、假设、证明、验证。 看到了一个系列的很好的博文：戴世强 - 谈科研方法 不要成为”操作工“！！！ 慢慢看，慢慢总结~ 阅读全文
posted @ 2017-01-16 17:14
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摘要：
想发好文章？先看好文献！ 生物信息分析类的文章都有着比较明显的套路，如果你深刻的掌握了这些套路，相信有一天你也能发Nature(子刊)。 Extremotolerant tardigrade genome and improved radiotolerance of human cultured cells by tardigrade-unique protein 先了解基本背景： 水熊虫... 阅读全文
posted @ 2017-01-16 16:26
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摘要：
DGE-seq和普通的transcriptomic profiling相比较有什么不同，有什么特点？ DGE就是用酶将mRNA切断，只使用靠近poly A的一小段RNA去测序。 #1 由于不是测定mRNA的全长，DGE的数据量比转录组要小一些； #2 DGE比转录组价格低一些； #3 DGE和转录组都可以分析所有基因的表达丰度，并且比较组间基因表达差异； #4... 阅读全文
posted @ 2017-01-16 12:40
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