王哲_UJN_MGG_AI

摘要： 主成分分析 rm (list = ls ()) library(vegan) library(tidyverse) library(ggalt) library(car) library(ggforce) library(ggpubr) library(patchwork) # 2. 定义所需的函数 阅读全文

摘要： 宏基因组测序相比于16S rRNA基因测序技术有几个主要的优势： 全面性：宏基因组测序提供了对整个微生物群落基因组的综合视角，而不仅限于16S rRNA基因。这意味着它能够捕捉到更广泛的微生物多样性，包括细菌、古菌、真菌以及病毒。 功能信息：宏基因组测序不仅能够鉴定微生物群落中的物种，还能提供关于它 阅读全文

摘要： 固氮、溶磷和解钾过程： [1] Bulgarelli, D., Schlaeppi, K., Spaepen, S., van Themaat, E. V. L., & Schulze-Lefert, P. (2013). Structure and functions of the bacteri 阅读全文

摘要： 首先，什么是nodesize值，以及它的含义和作用。 nodesize值是指定每个叶子节点最少包含的样本数量的整数值，它是随机森林算法的一个重要的参数，它影响了随机森林的复杂度和泛化能力。 nodesize值的含义和作用是控制决策树的生长和剪枝，以及随机森林的随机性和准确性。 当nodesize值较 阅读全文

摘要： rm(list=ls()) #清空工作环境 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\LDA") #设置工作目录 library(tidyverse) #包含了一系列与数据分析和可视化相关的包 library(microeco) #生态学分析的包 libra 阅读全文

摘要： rm (list = ls ())#清除所有变量 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\NMDS\\Fun") #设置工作目录 # 1. 导入所需的库。 library(vegan) library(ggplot2) # 2. 定义所需的函数。 myda 阅读全文

摘要： “留一法"是一种常用的模型验证方法，也被称为"留一交叉验证”。这种方法的基本思想是：如果有N个样本，我们就进行N次训练和验证，每次选择一个样本作为测试集，其余的N-1个样本作为训练集。这样，我们就可以得到N个模型的测试结果，然后对这N个结果取平均，作为最终的模型性能。 这种方法的优点是每个样本都被用 阅读全文

摘要： rm (list = ls ()) #清除所有变量 # 1. 导入所需的库。 library(vegan) #提供了进行社区生态学分析的函数，包括多元分析、物种多样性分析等。 library(tidyverse) #一组用于数据科学的R包，包括ggplot2、dplyr、tidyr、readr、pu 阅读全文

摘要： 以上是学习的源头，载入了自定义包，但是有修改颜色的需求，只能自己重新定义函数。 rm (list = ls ()) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\alpha多样性_箱线图") library(devtools) alpha_boxplot_cus 阅读全文

摘要： 在随机森林中，对于回归任务和分类任务，重要性度量的计算方式是不同的。 回归任务：使用的是 %IncMSE 和 IncNodePurity。 %IncMSE：这是一个基于均方误差（Mean Squared Error，MSE）的度量。当我们对某个变量进行排列时，预测误差的增加程度被用作该变量的重要性度 阅读全文