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2023年12月28日
R：计算alpha多样性指数
摘要： rm(list=ls()) #清除R环境中的所有对象 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹") #设置工作目录 library(vegan) # 读取数据 df <- read.table("otu_table_R.txt", header 阅读全文
posted @ 2023-12-28 16:52 王哲MGG_AI 阅读(425) 评论(0) 推荐(0)
偏最小二乘路径模型（PLS-PM）的详细结果
摘要： PARTIAL LEAST SQUARES PATH MODELING (PLS-PM) MODEL SPECIFICATION 1 Number of Cases 40 2 Latent Variables 5 3 Manifest Variables 11 4 Scale of Data Sta 阅读全文
posted @ 2023-12-28 10:40 王哲MGG_AI 阅读(11377) 评论(3) 推荐(1)
偏最小二乘路径模型（PLS-PM）的结果摘要
摘要： > dat_pls Partial Least Squares Path Modeling (PLS-PM) NAME DESCRIPTION 1 $outer_model outer model 2 $inner_model inner model 3 $path_coefs path coeff 阅读全文
posted @ 2023-12-28 09:52 王哲MGG_AI 阅读(1357) 评论(1) 推荐(1)
2023年12月26日
R：PCoA（第三版）
摘要： rm (list = ls ()) #清除所有变量 # 1. 导入所需的库。 library(vegan) #提供了进行社区生态学分析的函数，包括多元分析、物种多样性分析等。 library(tidyverse) #一组用于数据科学的R包，包括ggplot2、dplyr、tidyr、readr、pu 阅读全文
posted @ 2023-12-26 10:24 王哲MGG_AI 阅读(230) 评论(0) 推荐(0)
R：NMDS（第三版）
摘要： # 清除所有变量 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\NMDS") # 导入所需的库 library(vegan) library(ggplot2) # 读取数据 mydata <- re 阅读全文
posted @ 2023-12-26 10:23 王哲MGG_AI 阅读(156) 评论(0) 推荐(0)
R：计算相对丰度最简单的R代码
摘要： rm (list = ls ()) #清除所有变量 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\PCoA") #设置工作目录 # 加载必要的库 library(dplyr) # 读取数据，假设您的文件名是 data.txt # 请根据您的文件实际 阅读全文
posted @ 2023-12-26 09:43 王哲MGG_AI 阅读(2246) 评论(4) 推荐(0)
相对丰度与绝对丰度
摘要： 绝对丰度和相对丰度是生态学和生物统计学中常用的两个概念，它们用于描述物种在特定环境中的分布和数量。 绝对丰度（Absolute Abundance）： 绝对丰度是指在特定区域或样本中某个物种的实际数量。 它通常用个体数来衡量，比如在一个湖泊中特定鱼类的个体总数。 绝对丰度提供了物种在给定环境中的具体 阅读全文
posted @ 2023-12-26 09:39 王哲MGG_AI 阅读(8772) 评论(3) 推荐(0)
2023年12月18日
R ：随机森林（测试版3）
摘要： # 清空当前环境中的所有对象 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) library(tidyverse) library(pROC) libra 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:53 王哲MGG_AI 阅读(63) 评论(0) 推荐(0)
R ：随机森林（测试版2）
摘要： # 清空当前环境中的所有对象 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) library(tidyverse) library(pROC) libra 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:53 王哲MGG_AI 阅读(22) 评论(0) 推荐(0)
R : 随机森林（测试版1）
摘要： # 清空当前环境中的所有对象 rm (list = ls ()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) #随机森林 library(tidyverse) #数据分析和可视化 l 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:51 王哲MGG_AI 阅读(160) 评论(0) 推荐(0)
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