王哲_UJN_MGG_AI

摘要： statistic： 这一列表示Wilcoxon秩和检验的统计量值。对于Wilcoxon秩和检验，统计量通常是基于两组数据秩次的和差异计算得出的。具体来说，它可能是W统计量（也称为Wilcoxon秩和统计量），该统计量反映了两组数据中观测值秩次之和的差异。统计量的具体值可以用来计算p值，进而判断两组 阅读全文

摘要： # 清除所有变量 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\Co-occurrence Network\\图例") # 载入ggplot2包 library(ggplot2) # 创建一个数据框 阅读全文

摘要： Degree (度) 定义： 度是网络中一个节点的基本特性，表示直接连接到该节点的边的数量。在无向图中，一个边连接两个节点，因此每个边为节点增加一个度。在有向图中，度被分为入度和出度，分别计算指向节点和从节点出发的边的数量。 应用： 度量了节点的直接连通性。一个高度的节点通常表示该节点在网络中具有较 阅读全文

摘要： # 清除所有变量 rm(list = ls()) # 加载必要的包 library(ggplot2) library(ggpubr) library(dplyr) library(multcompView) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desk 阅读全文

摘要： # 清空当前环境中的所有对象 rm (list = ls ()) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\Stacked bar chart") #设置工作目录 library(ggplot2) # 用于绘图 library(ggalluvi 阅读全文

摘要： 摘要 植物与微生物的相互作用影响生态系统的功能，而不同的植物物种会影响相关微生物。然而，不同基因型的玉米如何塑造根际微生物群落的结构和功能仍然研究不足。在本研究中，通过高通量测序和生物信息学分析，比较了三种基因型的玉米在幼苗期和成熟期根际微生物群落的结构。结果显示，天诺早60（N）在这两个时期的细菌 阅读全文

摘要： 从Phytozome上导出来的，这个用于后续的基因家族分析，通过此脚本将序列变为一行 # 清除所有变量 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:/Users/Administrator/Desktop") # 定义读取和处理序列数据的函数 process_sequence 阅读全文

摘要： rm (list = ls ()) #清除所有变量 # 1. 导入所需的库。 library(vegan) library(tidyverse) library(ggalt) library(car) library(ggforce) library(ggpubr) library(patchwor 阅读全文

摘要： rm(list = ls()) # 清除所有变量 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\circlize") library(sf) library(ggplot2) theme_set(theme_bw()) library(rnatur 阅读全文

摘要： Chao1算法是一种用于估计生物多样性的方法，特别是在微生物群落中。让我为您解释一下其计算原理。 准备： 在理解Chao1指数之前，我们需要理清两个概念： Singletons：仅包含一条read的OTU（操作分类单元）。 Doubletons：仅包含两条reads的OTU。 想象一个放满各种各样玩 阅读全文