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第八章：比较基因组学与分子演化 生命演化·中性突变理论与分子钟假说·分子序列演化·密码子使用偏好·选择压力、同义与非同义替换率·系统发育树·群体基因组学 生物的祖先是一个 宏进化、微进化与超微进化 明进化之光，格生命之谛 “Nothing in biology makes sences except 阅读全文
posted @ 2025-03-24 11:35
wuhaoliu
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第七章：基因组信息学与数据资源 基因组信息学·基因组数据资源 NCBI生物信息数据库 PubMed学术论文数据库 欧洲EBI UniProt蛋白质数据库 Expression Atlas基因表达数据库 基因关联分析知识数据库 GWAS Catalog 国内基因组信息数据库 国家生物信息中心CNCB和 阅读全文
posted @ 2025-03-23 23:31
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第六章：基因组注释 基因组注释的定义·基因组注释的复杂性·基因组结构注释·基因组功能注释·基因组注释实例 基因组测序的完成-->基因组注释的开始 1. 基因组注释 基因组的结构注释（Structural Annotation）：预测基因位置和结构信息 基因组的功能注释（Functiondal Ann 阅读全文
posted @ 2025-03-23 18:31
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第五章：基因组变异 自然变异（基因组层面，染色体层面，基因层面，碱基层面） · 人工变异（基因编辑） 1. 全基因组复制（WGD）变异 日本遗传学家 于 1970年提出 基因复制和全基因组复制猜想； 全基因组复制（又称多倍化事件，在植物，动物和真菌中都有发生）： 是新遗传物质产生的主要机制； 会导致 阅读全文
posted @ 2025-03-22 21:39
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第四章：基因组结构 基因组结构：基因组大小，GC含量，基因数量，染色体 基因结构：中心法则，内显子，外显子，转座子，可变剪切，CpG岛 1. 基因组结构 人类基因组数目：30亿个碱基对（base pair）组成，数量为3Gbp。 基因组计量单位： 基础单位：碱基对（base pair），简称bp 人 阅读全文
posted @ 2025-03-22 17:28
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第三章：基因组图谱与测序 基因组遗传图谱 · 基因组物理图谱 · DNA测序技术 · 基因组测序策略 · 单细胞测序技术及其发展 1. 为什么要对除人类以外的其它物种测序呢？ 答：人类全基因组数据大小为3100Mb，包含22000个基因，而线虫基因组只有100Mb，却也包含18000个基因。因此，有 阅读全文
posted @ 2025-03-22 16:56
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第二章：从基因组学到精准医学 本章介绍人类基因组计划之后陆续开展的研究计划： 人类基因组计划：目标是攻克癌症； 国际人类基因组单体型图计划（HapMap） 千人基因组计划； DNA元件百科全书计划：是对人类基因组的注释研究计划；主要研究的是人类基因调控序列，并成功鉴定出人类基因组中已知功能和未知功能 阅读全文
posted @ 2025-03-22 15:34
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第一章：基因组学发展史 以史为鉴，可以知兴替 吴兢 《贞观政要》 基本概念理解：基因，基因组，基因组学都是什么？ 人类基因组计划： 计划前期的技术积累； 该计划发展历程； 该计划的重要影响和意义； 1. 基因、基因组和基因组学的概念： 基因（Gene）： 基因是指能够产生一条编码蛋白或RNA产物的核 阅读全文
posted @ 2025-03-21 17:32
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第一幅 代码如下： # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Tue Sep 3 10:27:02 2024 @author: 小怪兽 """ import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from matp 阅读全文
posted @ 2025-03-07 15:32
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【翻译】空间转录组学（Spatial transcriptomics）技术可生成具有空间背景信息的基因表达谱，其分析需要结合空间信息的工具以完成三大核心任务：空间聚类（spatial clustering）、多样本整合（multisample integration）和细胞类型反卷积（cell-ty 阅读全文
posted @ 2025-02-10 23:30
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