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一棵开花的树sysu
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2021年6月6日
in文件——蒙脱石和水盒子合并
摘要: # INITIALIZATION echo screen dimension 3boundary p p patom_style fullunits real # 变量定义 variable filename1 index mergevariable T0 equal 300 #初始温度设定为298
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posted @ 2021-06-06 22:39 一棵开花的树sysu
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2021年6月5日
如何修改data文件中原子的序号
摘要: 问题:在MS软件导出car、mdf文件后,因为通过lammps的msi2lmp.exe所导出来的data文件,原子序号不按照我们所想要排列的顺序,如何修改? 方法: 1.先打开car、mdf文件 2.直接通过复制、粘贴的方式,将想要排在最前边的原子的信息放在前边即可。
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posted @ 2021-06-05 17:32 一棵开花的树sysu
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2021年6月1日
in文件——生成水盒子的快捷方法、各种水分子参数spc、spc/e、tip4p等
摘要: 生成水盒子的in文件代码和data文件见以下链接: https://files.cnblogs.com/files/sysu/creat-water-box.zip?t=1698124054&download=true 或者下载自:https://github.com/weipc3/Creat-MD
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posted @ 2021-06-01 19:41 一棵开花的树sysu
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2021年5月30日
linux执行不了shell脚本(如xxx.sh)-解决办法
摘要: https://blog.csdn.net/this_capslock/article/details/17415409
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posted @ 2021-05-30 22:14 一棵开花的树sysu
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putty中文的设置
摘要:
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posted @ 2021-05-30 22:10 一棵开花的树sysu
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Atomsk的安装和使用
摘要: 1.安装: 官网下载:https://atomsk.univ-lille.fr/dl.php 2.cmd如何打开:按住“菜单”+R,再输入cmd,即可打开; 3.cd 进入装有Atomsk的文件夹,输入atomsk的相关命令即可。 学习资料: 1.b站视频:https://www.bilibili.
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posted @ 2021-05-30 10:55 一棵开花的树sysu
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2021年1月14日
表面能的理解+lammps计算
摘要: 1.什么是表面能?(可以去b站和youtube上看相关的介绍和解说,很多老师解释得很详细) 定义1:将体相变成表面晶体所需要的能量。 定义2:表面能是恒温、恒压、恒组成情况下,可逆地增加物系表面积须对物质所做的非体积功(单一相)。(对比:粘附功W12是指从相邻两相1和2之间分离需要做的功(两相),可
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posted @ 2021-01-14 20:50 一棵开花的树sysu
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2020年12月8日
notes 1——分组、计算vacf、输出thermo变量(单个原子温度)、dump出多物理量、chunk算密度分布等、delete分组原子、移动原子、隔多少步输出一个restart文件、计算各类能量、旋转原子、两个组之间的非键相互作用、输出xyz轨迹文件-带元素类型
该文被密码保护。
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posted @ 2020-12-08 15:28 一棵开花的树sysu
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lammps能量单位换算(转载)
摘要: 转自:https://www.cnblogs.com/Simulation-Campus/p/8823291.html 1 electron-volt [eV] = 11604.5250061657 kelvin [K] https://www.translatorscafe.com/unit-co
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posted @ 2020-12-08 15:08 一棵开花的树sysu
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2020年11月25日
通过晶格常数sc建立水分子
摘要: 1.lammps的代码如下: region 1 block -0 50 0 50 0 50 units box side in #创建区域#创建一个长方体区域,名称为1,坐标的单位就与命令units说指定的距离单位相同 create_box 2 1 & bond/types 1 & angle/ty
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posted @ 2020-11-25 19:32 一棵开花的树sysu
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