一棵开花的树sysu

摘要： 1. 界面能、界面张力 （转摘自：https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%A1%A8%E9%9D%A2%E8%83%BD） （该算法来自文献：Computer simulation of polyolefin interfaces，1999） 阅读全文

摘要： 能量-力之间的关系：能量对位移的求导就等于力。 阅读全文

摘要： 转摘自知乎：https://zhuanlan.zhihu.com/p/359014805?utm_medium=social&utm_oi=869273158199443456。这个解释很清晰，帮助理解。 一、广义胡克定律 材料在线弹性范围内，应力 与应变 成正。由于一些剪切条件的等价性和对称性，对 阅读全文

摘要： 摘自：https://mp.weixin.qq.com/s/kJ1aNa77BLi4EdthEYVJSg （小马老师） 在lammps模拟中，有“刚体”和“固定”的设置，在平时咨询过程中，发现还有小伙伴对两者的区别分不大清楚。 在设置”刚体“的时候使用固定的命令，反之也有。 ”刚体“和”固定“的设置 阅读全文

摘要： 摘自：https://mp.weixin.qq.com/s/9AXfK4pttzhwZ3H7U-JIgw （小马老师） 本文介绍lammps in文件编写过程中一个常见的错误：重复积分。 分子动力学模拟的主要运算是原子的积分运算，通过求解积分方程得到原子的受力以及计算原子的速度，从而得出下一时刻原子 阅读全文

摘要： 摘自：https://mp.weixin.qq.com/s/qFQC7ZQJWGou9wD9WkziAQ 本文继续介绍lammps基本操作命令。 在lammps模拟中，所有的原子处在一个封闭的空间内，这个空间称为盒子（box）。 创建box有两种方法，一是在lammps中使用create_box命令 阅读全文

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摘要： ###############计算单个原子的温度#################compute KE pp ke/atomvariable KB equal 8.625e-5 # 玻尔兹曼常数，eV/K， 这个数要根据计算unit来确定，（1）如果是real单位，能量单位为kcal/mol，则KB 阅读全文

摘要： 1.python script： import numpy def modify(frame, data): # Access the per-particle displacement magnitudes computed by the # 'Displacement Vectors' modi 阅读全文

摘要： 1.ave/chunk计算层间分布情况 #log mmtnpt.logvariable filename1 index density # INITIALIZATION echo screen dimension 3boundary p p p atom_style fullunits real # 阅读全文