摘要:
近期,华中农大赵虎&郭亮团队在JIPB上发表发表综述:Functional genomics of Brassica napus: Progresses, challenges and perspectives,总结了近年来油菜功能基因组学的研究进展,包括种质资源、组学数据库和克隆功能基因的可用性以 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:39
生物信息与育种
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摘要:
近期,拜耳公布了一项开创性的试点计划,引入了一个专业的生成式人工智能(GenAI)系统,旨在提高效率,并增强农艺师的日常工作能力。利用专有的农艺数据,拜耳利用其全球农艺师网络数百年的丰富经验,训练了一个复杂的大型语言模型(LLM)。 GenAI系统代表了农业技术的重大飞跃,可以快速准确地回答与农艺学 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:38
生物信息与育种
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摘要:
long long ago,小野记录了关于重测序基因定位和GWAS相关的笔记。打开古老的文件夹,发现有些东西依然不过时,零零散散,随意发布。 QTL定位策略: 群体类型:作图群体,自然群体 选材策略:全群个体分析,选择基因型分析,混合分组分析 优点:适合稀有基因研究;群体可控,目的性和结果预期性强 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:36
生物信息与育种
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摘要:
近日,Wing-Kin Sung(宋永健)博士在Nature Methods发文Creating diploid assemblies from Nanopore and Illumina reads with hypo-assembler,报道其开发的基因组组装新工具hypo-assembler, 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:35
生物信息与育种
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摘要:
摘要:为探究我国智慧农业未来发展的目标、任务与政策,本文基于系统工程学视角,阐释了智慧农业的概念与内涵,介绍了国外智慧农业相关战略布局与行动计划,分析了我国智慧农业发展现状、特点以及与国际上的差距,提出了我国智慧农业未来发展目标、重点任务与政策建议。美、德、英、日等国在农业传感器、农业大数据智能、农 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:35
生物信息与育种
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摘要:
近日朋友圈又被“智慧育种”刷屏了,源自于中国农科院李慧慧老师团队和阿里巴巴联合在Mol Plant上发布的首个全流程智慧育种平台。详见:Mol Plant | 中国农科院作科所和阿里巴巴联合发布首个全流程智慧育种平台,恭喜李老师! 据网上资料显示,中国农科院作科所与阿里巴巴(公益)于2021年达成合 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:33
生物信息与育种
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摘要:
分享一篇近期来自华中农大王旭彤老师(即SoyDNGP作者)的综述,以SoyDNGP为例。建议参考之前的推文:基于深度学习框架的基因组预测新模型SoyDNGP。 摘要 人工智能(AI)与作物育种的结合代表了向数据驱动型农业实践的范式转变,旨在提高作物改良的效率和精度。本文对大豆深度神经网络等基因组预测 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:32
生物信息与育种
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通过代码指导 Minimmap2 基因组比对和 seq-seq-pan 泛基因组比对,并在 R 中进行可视化。本教程提供了一个示例,该示例使用Heliconius butterflies中optix基因位点的两种单倍型。 教程: https://stevenvb12.github.io/ 代码: h 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:29
生物信息与育种
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mapmixture简介 群体结构(admixture)绘图,R包pophelper是神器(https://github.com/royfrancis/pophelper),立个flag,下次投稿。今天给大家介绍的是另一个R包mapmixture,同样可绘制群体结构图,并与地图分布相结合。小小R包竟 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:28
生物信息与育种
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摘要:
近日,扬州大学张韬团队在aBIOTECH发表综述“Integrating machine learning and genome editing for crop improvement”。 随着大数据的积累,越来越多基于机器学习的方法被应用于植物科学研究,包括功能性基因和调控元件的挖掘,蛋白质结构 阅读全文
posted @ 2024-06-16 10:27
生物信息与育种
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