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摘要: 原始论文:Machine Learning on Human Muscle Transcriptomic Data for Biomarker Discovery and Tissue-Specific Drug Target Identification 基本常识: 什么是biomarker?Wh 阅读全文
posted @ 2021-12-21 21:05 Life·Intelligence 阅读(185) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Excel也是表格,但是可视化非常不便,也难以修改,所以不适合收集某些信息。 需求举例:读文献,收集整理统计。 读文献不难,拿到原文就开始读,大部分时候读完就扔了,最多留个PDF,导入到Endnote里,过段时间就忘了; 进阶一点,专门写一篇blog,深入分析这篇文章,但这样还是难以系统性地整理过去 阅读全文
posted @ 2021-12-21 17:43 Life·Intelligence 阅读(891) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 从一篇文章开始的学习:Representation learning of RNA velocity reveals robust cell transitions 知乎上的通俗解释: 如果你想要用一种方式来说明一个人脸,你会怎么做呢? 你可能会用一段话来表示:“这个人是国字脸,眼睛很小,鼻子……” 阅读全文
posted @ 2021-12-20 16:55 Life·Intelligence 阅读(711) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 目的:看懂荧光图 基本名词和英文: Blood vessels:血管 Four chambers Left/right atrium:左右心房 Left/right ventricle:左右心室 Interatrial septum:房间隔 Interventricular septum:室间隔 V 阅读全文
posted @ 2021-12-17 13:43 Life·Intelligence 阅读(659) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录组,需要提前了解一下基本的data。 废话不多说,先把示例数据和教程跑一遍,找找感觉。 参考:Seurat4.0系列教程22:空间转录组的分析、可视化与整合 样本制备 - 获取高质量数据的前提 参考: Visium Spatial Gene Express 阅读全文
posted @ 2021-12-16 19:02 Life·Intelligence 阅读(757) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 基本问题: RNA的起源、定位和意义 明确RNA的各种概念分类 各种RNA的基本结构和功能 意义 有一种学说:RNA是生命的起源。 先有鸡(DNA)还是先有蛋(蛋白质),好像都不太可能,那有没有可能先有RNA?桥接了DNA和蛋白质,RNA本身也是一种酶。 分类 首先按是否coding,分coding 阅读全文
posted @ 2021-12-15 13:49 Life·Intelligence 阅读(1440) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 起因:知道BioNTech是搞mRNA的,但却不知道其是搞癌症mRNA疫苗起家的,有点惊讶。 问题: 除了传染病,还有哪些疾病能被疫苗预防? 疫苗起预防作用的机制是什么?传统和新型 有哪些已上市或临床后期的明星疫苗? 疫苗主要是利用了自身的免疫系统,伪造已知抗原,提前训练自身免疫系统,在真正面对抗原 阅读全文
posted @ 2021-12-14 19:02 Life·Intelligence 阅读(323) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 问题: 商业银行和投资银行的区别? 顶部投行有哪些?为什么投行这么屌? 投行一般分哪些部门? 投行的职级怎么分?如何晋升? 投行在金融圈里扮演的作用? 生物医药跟投行有什么联系? 九大行 Goldman Sachs - 高盛 JPMorgan Chase & Co - 小摩 Morgan Stanl 阅读全文
posted @ 2021-12-13 20:39 Life·Intelligence 阅读(483) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 基本问题: 医保目录和带量采购的区别? 集采意味着什么?为什么要推行? 集采对国家、对消费者和对药企分别有什么影响? 如何分析每年医保目录的重点? 中国生物医药市场总额,以及它们的支付途径? 为患者减负的300亿由谁来买单? 谈判失败的药品主要是什么?为什么失败? 为什么恒瑞的药进了医保,股价仍然不 阅读全文
posted @ 2021-12-03 21:59 Life·Intelligence 阅读(1130) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 问题: 什么是金融?目的是什么?包括哪些玩家? 什么是资本?在真实世界发挥着什么样的作用? 你对金融或者财经行业有多深的认知?买方和卖方各个职级的人每天都在干什么? 什么是媒体和自媒体?在社会里起着什么样的角色? 什么是视野和格局?如何自我构建? 知识与信息的认知理论 通过某种渠道可以获取的知识和信 阅读全文
posted @ 2021-11-30 00:02 Life·Intelligence 阅读(769) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 问题: 买方和卖方的区别?举例说明 起源:为什么会出现卖方分析师?要他们干啥?为什么证券公司要花大价钱来搞自己的研究所? 行业现状:什么是佣金分仓?基金在里面是什么角色? 如何才能从众多分析师中脱颖而出?增加深度 为什么智库和产业专家很重要?人脉对分析师的重要程度? 深入了解浑水做空瑞幸的报告 - 阅读全文
posted @ 2021-11-26 00:27 Life·Intelligence 阅读(963) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 核心问题: 罕见病市场如此之大,敢不敢想象:未来罕见病诊断和治疗费用降到1万以内。 罕见病诊断的现状 罕见病治疗的现状 问题: 罕见病定义和特点 中国和国外的罕见病市场是怎样的? 是否有药可医,哪些环节出现了问题? 为什么罕见病药物不足? 国家有哪些相关政策支持罕见病? 罕见病定义: 罕见病特点: 阅读全文
posted @ 2021-11-20 17:37 Life·Intelligence 阅读(165) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 基本步骤: 首先选一个主题,比如基因治疗; 其次开始广泛阅读,了解该主题的基本概念,搭建起基本的框架; 然后选择一个细分领域,必须细到你2-3周能够全部搞清楚,比如基因治疗里面的基因替代; 然后开始重复发散和收敛的思维,直到把报告打磨到满意为止; 现在我已经到第四步了,通过发散思维,已经搭建好了基因 阅读全文
posted @ 2021-11-19 00:39 Life·Intelligence 阅读(255) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 历史上有些事情确实让人激情澎湃或者无限唏嘘,我们可以从中吸取很多经验教训,故事会是丰满人思维血肉的重要方式。 中国首个基因治疗产品“今又生”的惨败落场 - 彭朝晖 世界上第一个基因治疗药物在深圳诞生了! 国家领导人为这个创新药起了名字 为何上市后却一败涂地? 砒霜治疗白血病的研究历史 魏则西 贺建奎 阅读全文
posted @ 2021-11-18 13:58 Life·Intelligence 阅读(129) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 前导篇:免疫反应 | Immune Response 免疫系统由免疫器官(脾脏、骨髓、胸腺、淋巴结、扁桃体等)、免疫细胞(淋巴细胞,吞噬细胞等)以及免疫分子(淋巴因子、免疫球蛋白、溶菌酶等)组成。 前言 这个时代的医学,不懂免疫系统那就完全out了: 新冠疫苗,疫苗无疑让人类对免疫系统利用的到达了一 阅读全文
posted @ 2021-11-12 13:35 Life·Intelligence 阅读(2143) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 转基因(细胞和基因治疗)的基本技术 问题: 什么是质粒?Plasmid,质粒是裸露的环装DNA 什么是细胞转染、质粒转染? 什么是GMP质粒?国内有哪些公司有能力生产GMP质粒? 质粒是如何高质量批量生产的?质粒生产的成本和瓶颈是什么? 质粒的特性?质粒的承载能力是多少?多个质粒的兼容性? 什么是质 阅读全文
posted @ 2021-11-10 12:35 Life·Intelligence 阅读(3417) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 收集资料: gene therapy相关的近5年的review 已有的研报 微信公众号文章 YouTube的科普视频 先看review,了解专业术语,整个行业基本的逻辑框架。 了解一个技术最快的途径就是微信和YouTube上的科普视频和文章。 最后要看别人的研报,学习别人的分析逻辑和思路,同时给出自 阅读全文
posted @ 2021-11-08 18:45 Life·Intelligence 阅读(232) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 前导 (转)导师神总结:读博失败的10个作死大法 (转)字字诛心 | 张启发院士给自己的博士生写的一封信,值得细读! 哈佛大学教授刘小乐:我与生物信息学的不解之缘 文献阅读方法 & 如何阅读英文文献 - 施一公(转) (转)像运动员一样的数学家——采访北京大学许晨阳教授 (转)如何成为顶级生物信息学 阅读全文
posted @ 2021-10-29 13:51 Life·Intelligence 阅读(781) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 2023年08月15日 【成功检测出tdTomato,yes】 cp best.td.cdx2.fasta tdTomato.fa vi tdTomato.fa # change fasta name to tdTomato cat tdTomato.fa | grep -v "^>" | tr - 阅读全文
posted @ 2021-10-18 18:14 Life·Intelligence 阅读(1079) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文献复现是非常重要的技能,能迅速模仿顶尖的研究也是不错的能力,中二的叫法就是“写轮眼”。 核心: 熟悉数据 大致知道基本的算法 知道分析核心的目的 复现第一篇: The support of human genetic evidence for approved drug indications - 阅读全文
posted @ 2021-10-07 21:53 Life·Intelligence 阅读(457) 评论(0) 推荐(0)
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