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2026年3月5日
从零学mRNA 疫苗 | 基于Transformer神经网络的脂质纳米颗粒(LNP)设计
摘要: 最近正式踏入全新赛道,此前做科研服务,如今加入mRNA疫苗企业,一切都要从零开始系统学习。我相信,最好的学习方式就是持续输出,因此后续会在公众号定期更新mRNA疫苗相关的技术干货与学习笔记。 唠一句实在嗑,尽管mRNA算得上当下生物专业里最前沿、最热门、最具前景的方向,可实际收入却依旧低于深圳市平均
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posted @ 2026-03-05 15:04 生信探索
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2026年3月3日
从零学 mRNA 疫苗 | 全流程核心知识点总结(序列优化、LNP优化、作用机制)
摘要: 最近正式踏入全新赛道,此前一直做科研服务工作,如今加入mRNA疫苗企业,一切都要从零开始系统学习。我始终相信,最好的学习方式就是持续输出,因此后续会在公众号定期更新mRNA疫苗相关的技术干货与学习笔记。 唠一句实在嗑,尽管mRNA算得上当下生物专业里最前沿、最热门、最具前景的方向,可实际收入却依旧低
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posted @ 2026-03-03 10:00 生信探索
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2025年8月28日
一文看懂 Mantel 相关性连线图:万物互联 X与Y的关联原来这么可视化!
摘要: Mantel 检验介绍 Mantel 检验是一种用于评估两个矩阵之间相关性的统计方法,主要应用于生态学研究中。它的核心思想是: 1计算两个矩阵各自的距离矩阵(或相似性矩阵) 2检验这两个距离矩阵之间是否存在显著的相关性 3通过置换检验(permutation test)来评估相关性的显著性 imag
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posted @ 2025-08-28 22:39 生信探索
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2025年8月14日
三行代码搞定AutoDock Vina批量分子对接
摘要: 分子对接是药物发现和蛋白研究中的核心步骤,但传统流程中,从分子下载、软件配置到结果分析,往往需要繁琐的操作和大量参数调试,让新手望而却步。 今天就给大家分享一套极简方案——用3行核心代码搞定基于AutoDock Vina的分子对接,甚至还能借助Gnina的CNN评分提升精度!无需手动点击,全程命令行
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posted @ 2025-08-14 20:05 生信探索
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一文读懂PDB格式 protein database bank
摘要: 最近在做分子对接和分子模拟,涉及到了一些盲区,必去pdb文件是按照列位数储存信息的,跟其他文件的空格或者制表符分割很不同,所以也可能出现一些错误,比如信息错位,因此有必要了深入解下结构相关的格式pdb、cif、sdf等等 pdb的分子对接前处理包括去除非氨基酸残基、去水、加氢、末端修复等等,在上次的
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posted @ 2025-08-14 20:00 生信探索
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2025年8月7日
大队列CT胰腺癌PANDA 模型 医生结合AI后,病灶检测灵敏度提升 8.5%,胰腺癌识别灵敏度提升 20.5%,住院医师性能接近专家水平
摘要: 胰腺癌(PDAC)因早期难发现、预后极差被称为“癌王”,多数患者确诊时已处于晚期,错失手术机会。近期,《Nature Medicine》发表的一项研究显示,中国团队研发的AI模型PANDA可通过非增强CT精准检测胰腺癌,为大规模筛查提供了新工具。 作者提供了在线网站:panda.medofmind.
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posted @ 2025-08-07 21:36 生信探索
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2025年8月6日
影像+病理+转录组+基因组+蛋白组多模态的胶质瘤分型 R包已发布可以直接使用 居然使用R语言分析的 !
摘要: MOFSR包:https://github.com/Zaoqu-Liu/MOFS 胶质瘤是成人最常见的恶性脑肿瘤,其中IDH野生型胶质母细胞瘤(GBM)恶性程度最高,5年生存率不足10%。由于其基因组、转录组等层面的高度异质性,传统单模态分型难以精准指导治疗。近期发表于《Nature Communi
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posted @ 2025-08-06 22:21 生信探索
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一区23分超简单CT影像组学:肺病早筛的新利器
摘要: 是一种高异质性的慢性炎症性疾病,以持续气流受限为特征。在我国,40岁以上人群COPD患病率达13.7%,但知晓率不足1%,大量患者因漏诊延误治疗。 肺功
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posted @ 2025-08-06 19:14 生信探索
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GIST 复发风险预测升级!影像 + 病理 + 临床多模态模型来了,精准度再突破
摘要: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39060449/ 研究概述 本文发表于《NPJ Precis Oncol》2024年,由中国医科大学等机构团队开展,旨在构建并验证一个多模态预测模型,以更精准预测胃肠道间质瘤(GIST)患者的无复发生存期(RFS),辅助临床决策(如T
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posted @ 2025-08-06 19:11 生信探索
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影像组学多模态模型预测肺癌新辅助免疫化疗 作者开源模型 可以用于自己研究中直接提取特征或者经过微调后再提取特征
摘要: 2024年一项发表于《Journal for ImmunoTherapy of Cancer》的多中心研究显示,通过术前平扫+增强CT构建的深度学习模型(LUNAI-fCT),可无创、精准预测患者病理完全缓解(pCR),为临床决策提供重要参考。 作者预训练的肺癌CT专用基础模型FM-LCT (htt
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posted @ 2025-08-06 19:09 生信探索
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