摘要:
分子对接是药物发现和蛋白研究中的核心步骤,但传统流程中,从分子下载、软件配置到结果分析,往往需要繁琐的操作和大量参数调试,让新手望而却步。 今天就给大家分享一套极简方案——用3行核心代码搞定基于AutoDock Vina的分子对接,甚至还能借助Gnina的CNN评分提升精度!无需手动点击,全程命令行 阅读全文
posted @ 2025-08-14 20:05
生信探索
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摘要:
最近在做分子对接和分子模拟,涉及到了一些盲区,必去pdb文件是按照列位数储存信息的,跟其他文件的空格或者制表符分割很不同,所以也可能出现一些错误,比如信息错位,因此有必要了深入解下结构相关的格式pdb、cif、sdf等等 pdb的分子对接前处理包括去除非氨基酸残基、去水、加氢、末端修复等等,在上次的 阅读全文
posted @ 2025-08-14 20:00
生信探索
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