摘要： 测序： 如何计算测序深度，或产出的数据量？ 10的9次方=1G 如果测序的read是pair-end的、且每条read长150bp，则，平均测序深度为=（reads数×150bp×2）/（3*10的10次方）。 即：测序得到的碱基总数/人类基因组的碱基对数=平均测序深度。 比如，我想得到30x的测序 阅读全文

摘要： 人类基因组概况： 人类基因组由ATCG四种碱基组成，但是CG的含量低于50%，所以CG含量低于AT含量。 一个基因组的dna大约3ug。 snp： 平均每100到1000个碱基会出现1个SNPs，不过密度并不均匀。 如果按照每1000个碱基存在1个SNP来计算，人类30亿个碱基中，大约有300万个S 阅读全文

摘要： 常用的分子生物学实验技术： 离心技术： 是分离纯化蛋白质、酶、核酸（DNA、RNA）、细胞的最常用方法之一。 电泳（electrophoresis）：带电粒子在电场中向着与其所带电荷相反方向电极移动的现象。 可用于分离不同分子量的生物大分子。 1.蛋白质的电泳： 用途：蛋白质的定量。 2.核酸的电泳 阅读全文

摘要： z-score值： （某值-mean）/标准差=z-score zi=（xi-均值）/s，zi又称为标准分数。这是统计中的标准化公式。它给出了一组数据中各个数据的相对位置。 该公式的意义： 一个数减去均值，可认为是：该数偏离均值的程度。 因为，标准差可以认为是一组数的平均离散程度。所以，减去均值后再 阅读全文

摘要： David数据库也是进行GO过程注释、pathway注释的数据库。 注释步骤： upload->submit list(选择gene_symbol)->list->select species 阅读全文

摘要： HUM molecular genetics，IF=4.9，遗传学经典杂志，难投。 BJH（British journal of Hematology）,IF=5.1 AJH（American journal of Hematology），IF=5.3 Blood cancer journal，IF 阅读全文

摘要： GTEx database：该数据库是健康人贡献的组织的RNASeq的数据。还有snp信息。将snp信息与gene的表达水平结合起来。 donor： donor贡献的tissue。 gene表达水平（用FPKM表示gene的表达水平）受其周围snp的影响，这样的gene叫做egene。这样的snp叫 阅读全文

摘要： 1. 输入mouse的gene symble时，不能输入大写的gene symble。 比如：Sept8可以，SEPT8不可以。提示error：没有map。 比如：FBP1，提示no mapping。Fbp1，OK。 总结：小鼠和人的gene symble在大小写是不同的。全部大写的gene sym 阅读全文

摘要： 搜索“r ggplot2 how to enlarge some points in the scatter plot”： https://stackoverflow.com/questions/20251119/increase-the-size-of-variable-size-points-i 阅读全文

摘要： 神经元学说的历史 http://slx.yau.edu.cn/info/1106/1401.htm 神经学界的神经科学巨星。 神经元分类： 按突起分类： 假单极神经元pseudounipolar neuron、双极神经元bipolar neuron、多级神经元multipolar neuron。 按 阅读全文