摘要：
cfDNA： 用处： 诊断/监测、药物疗效/预后 mutation： 与cancer type、TMB、肿瘤异质性、克隆进化有关。 与age、cancer位置关联； 做病毒检测。抽血，用血清中的DNA、蛋白做病毒检测。 长度： 正常是160bp，肿瘤患者的cfDNA长度约132-145bp。 来源： 阅读全文
摘要：
靶向药（顺铂）的作用原理： 1. 只对增殖中的细胞有效。对正常细胞无效。而，癌细胞是处于高度增殖中的细胞。 它作用于DNA的大弯GC上，让其复制终止。所以，顺铂只对处于复制中的DNA起作用。否则，DNA高度压缩，不暴露在外面，顺铂无法起作用。 2. 顺铂（pt）-》CPS-3-》DME1-》细胞凋亡 阅读全文
摘要：
z-score： 比如，某样本的100个snv的深度差别很大。但是，想画这些点的深度图。值大的与值小的点，通过不同颜色很容易区分开来；但是，值大的与值中等大的点，不容易区分。这时，可以把深度转换为z-score，使深度值变小，再用不同颜色区分不同深度值。 R中进行normalization的方法： 阅读全文
摘要：
测序： 如何计算测序深度，或产出的数据量？ 10的9次方=1G 如果测序的read是pair-end的、且每条read长150bp，则，平均测序深度为=（reads数×150bp×2）/（3*10的10次方）。 即：测序得到的碱基总数/人类基因组的碱基对数=平均测序深度。 比如，我想得到30x的测序 阅读全文