摘要: 参考: http://www.bio-chain.com/news/html/?59.html http://www.bio-star.cn/news/%E6%88%91%E6%98%AF%E7%BB%86%E8%83%9E%E6%A0%B8%EF%BC%8C%E6%88%91%E4%B8%BA%E 阅读全文
posted @ 2019-11-29 09:34 zypiner 阅读(473) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 参考: https://zhuanlan.zhihu.com/p/26319993 https://cloud.tencent.com/developer/article/1483493 常规的RNA测序分三大类:转录组测序(我们平时最多提到的RNA-seq)、小RNA测序、以及近两年比较火热的环状 阅读全文
posted @ 2019-11-28 09:55 zypiner 阅读(2805) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 神经元核抗原:NeuN 1992年,Mullen等人报道了能够识别脊椎动物神经元特异的核蛋白单克隆抗体的产生(图2) [31] 。该蛋白被称为 神经核(NeuN),能够在成年小鼠中枢和外周神经系统的多数神经细胞类型中检测到。 参考文献: http://www.labome.cn/method/Neu 阅读全文
posted @ 2019-11-27 15:17 zypiner 阅读(1487) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 两个主流的单细胞测序技术:BD Rapsody和10x genomics。这两家的单细胞捕获技术不同。 10xgenomics起源于drop-seq技术,来自哈佛大学。10x与Drop-seq与类似的原理:一个油滴=一个单细胞=一个凝胶微珠=一个RNA-seq。利用微流控的原理捕获单细胞。10x g 阅读全文
posted @ 2019-11-27 11:18 zypiner 阅读(1004) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 问题: 安装cytoscape时,提示: error信息: No suitable Java Virtual Machine could be found on your system.The version of the JVM must be at least 1.8.0_152 and at 阅读全文
posted @ 2019-11-22 12:07 zypiner 阅读(5864) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: /usr文件系统 /usr 文件系统经常很大,因为所有程序安装在这里. /usr 里的所有文件一般来自Linux distribution;本地安装的程序和其他东西在/usr/local 下.这样可能在升级新版系统或新distribution时无须重新安装全部程序. /usr/bin 几乎所有用户命 阅读全文
posted @ 2019-11-22 10:41 zypiner 阅读(136) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 分析WGS的mutation时,我用pyclone将mutations聚成了四类。我试图解释每一类的含义,比如:致病的变异、耐药的变异、治疗敏感的变异.... cosmic signature呢,每个样本都有96个signature的信息,假设有10000个样本。用NMF或PCA将这些聚成了30类, 阅读全文
posted @ 2019-11-21 11:18 zypiner 阅读(1714) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Although meiosis shares similarities with mitosis—both rely on microtubules to partition chromosomes to opposite sides of a cell, which then divides t 阅读全文
posted @ 2019-11-18 15:22 zypiner 阅读(1085) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: neuron的功能和生存依赖于几个重要的biological process: 1. Communication 神经元不断地与相邻的脑细胞进行touch。 神经递质分子有特异性。每个神经递质分子bind to附近神经元的树突上特异的受体位点。 科学家估计,一个神经元与其它的神经元有7000个突触连 阅读全文
posted @ 2019-11-15 14:57 zypiner 阅读(300) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在R中,p.adjust可计算FDR值。参考网址:https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html/p.adjust.html 多重检验都得算q-value,即FDR值。原因如下: 参考我的博文:https://www.cnblogs. 阅读全文
posted @ 2019-11-08 14:05 zypiner 阅读(3198) 评论(0) 推荐(0) 编辑