摘要: KEGG mapper: 输入:cufdiff生成的差异基因列表(log2fold_change的绝对值>1, pvalue<0.01) 目的:在KEGG网站中,利用KEGG mapper工具进行pathway注释。 过程: 1. ID转换:将gene symbol转换为uniprobID 方法:利 阅读全文
posted @ 2019-10-17 09:30 zypiner 阅读(2599) 评论(0) 推荐(0)
摘要: gene symbol: TP53 gene ID:7157。Entrez Gene ID,它是目前国际上最权威的Gene ID编号! GENECODE:GENECODE来自Ensembl数据库。没有ID。它有gtf文件。 HGNC(人类基因命名委员会)只对人类基因进行命名。 HUGO Gene S 阅读全文
posted @ 2019-10-15 08:50 zypiner 阅读(13766) 评论(0) 推荐(0)
摘要: l 有三种从基因组角度阐明疾病机制的方法: 1. genetc linkage study:研究大量家系患者的基因组,发现致病的基因组上的变化。缺点:需要大量的家系成员,患病/非患病人员均需研究;且发现的是linkage region而不是causitive gene。 2. Candidate g 阅读全文
posted @ 2019-09-03 11:35 zypiner 阅读(583) 评论(0) 推荐(0)
摘要: DNA甲基化修饰早在子宫内就已发生, 从胎儿时期开始, 基因组DNA甲基化修饰程度便不断发生变化[48]。在冰岛人群的外周血细胞中进行了DNA甲基化与年龄的关联研究, 在11年内29%的冰岛人群显示出大于10%的甲基化程度改变, 这表明DNA甲基化程度在人体内是动态变化的[49]。 参考:阿尔茨海默 阅读全文
posted @ 2019-08-27 14:15 zypiner 阅读(753) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 明明我都已经设置OK了,为什么word引文处的格式让然是{Misa, 2015,38}的格式呢? 参考网址:http://www.cappchem.com/Html/948.html的内容。我点了一下word上面的“update citatons and bibliograph”。问题解决,引用格式 阅读全文
posted @ 2019-08-20 13:17 zypiner 阅读(1540) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 点击网址:https://portal.gdc.cancer.gov/,点击“Quick reseach”。 例如,输入:SLC4A8 R461W 输入:BRINP2 R371C 阅读全文
posted @ 2019-08-15 12:33 zypiner 阅读(725) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 方法一: 缩小图 方法二: 文件 -> 文档属性 -> 修改:宽度,高度,即可调整画布大小 阅读全文
posted @ 2019-08-09 15:42 zypiner 阅读(788) 评论(0) 推荐(0)
摘要: WGS(30x)发现的5%的变异,用target测序验证时,很难验证不出来的。比如,对某炎症性疾病,检测其基因组变异,发现的5%的变异,target没有验证出来。 用target测序(10000x)发现的5%的突变,实验验证时,可以验证出来。比如,某癌症,用实验验证5%的突变,验证成功。 为何如此呢 阅读全文
posted @ 2019-08-08 13:17 zypiner 阅读(360) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 《百度百科》: 在遗传学中,基因型决定表型。但表型相同的个体,可能具有不同的基因型,即一种性状可以由多个不同的基因控制。这种现象称为遗传异质性(gentic heterogeneity)。 在肿瘤研究中,genetic heterogeneity指的是:在癌组织里,每个细胞的基因组都是不一样的。这个 阅读全文
posted @ 2019-08-07 14:07 zypiner 阅读(1398) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Alzheimer disease的病理特征: AD is pathologically defined by severe neuronal loss, aggregation of amyloid β (Aβ) in extracellular senile plaques, and forma 阅读全文
posted @ 2019-07-09 10:57 zypiner 阅读(673) 评论(0) 推荐(0)