王哲_UJN_MGG_AI

摘要： # 加载所需的库 library(ggplot2) # 数据 # 创建两个向量B73和Mo17，分别存储两种玉米品种的Shannon多样性指数 B73 <- c(4.715703, 5.102193, ...[省略其他数值]... 4.254242, 4.446569) Mo17 <- c(5.22 阅读全文

摘要： 以上事学习的源头，根据课题实际做了一点修改 # 加载必要的包 library(vegan) library(ggplot2) # 从txt文件载入数据 mydata <- read.delim("mydata.txt", header = TRUE, sep = "\t") mygroups <- 阅读全文

摘要： 在非度量多维缩放（NMDS, Non-metric Multidimensional Scaling）中，"Stress"（应力值）是一个关键的统计量。它提供了对模型质量的评估。这里是其核心含义： Stress值的定义：它是原始距离和NMDS得到的低维空间距离之间的误差的度量。更具体地说，它是实际生 阅读全文

摘要： 以上是学习的源头 根据课题实际做了一些修改 library(ggplot2) library(ggridges) library(reshape2) library(ggsci) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop") otu <- read.table 阅读全文

摘要： # 读取txt文件 data <- read.table("your_input_file.txt", header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE) # 统计每个节点在V1和V2中的出现次数 V1_counts <- table(data$V1) V2_count 阅读全文

摘要： setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop") # 读取txt文件 microbial_names <- readLines("your_input_file.txt") # 使用正则表达式提取属水平的名称 genus_names <- sapply(micro 阅读全文

摘要： 学习的源头在上图，自己稍微做了点修改 library(reshape2) # 重塑数据框的包，可以实现长数据和宽数据之间的转化 # 加载ggalluvial包（绘图本图所用关键R包），基于ggplot2的ggalluvial包可用来绘制冲击图 library(ggalluvial) library( 阅读全文

摘要： Disease-induced changes in plant microbiome assembly and functional adaptation Gao et al. Microbiome(2021) 9:187https://doi.org/10.1186/s40168-021-011 阅读全文

摘要： 玉米中的‘dosage-effect defective1’的父系印记对种子重量异质性的贡献 从历史上看，异质性效应曾被假设为花粉对种子表型的独特遗传贡献，但大多数例子代表了孟德尔性状的标准互补作用。我们在玉米（Zea mays）中确定了印记的剂量效应缺陷1（ded1）位点作为种子大小和发育的父系调 阅读全文

摘要： P Value: P值（P value）是在假设检验中一个非常关键的概念。它提供了一个量化的方法来评估观察到的数据与零假设（null hypothesis）下期望的数据之间的差异。具体来说，P值是在零假设为真的条件下，观察到当前统计量或更极端统计量的概率。 以下是关于P值的更详细解释： 定义：P值是 阅读全文