黑逍逍 - 博客园

2023年6月23日

摘要：是指位于一对同源染色体相同位置上控制同一性状不同形态的基因没懂阅读全文

posted @ 2023-06-23 01:25 黑逍逍阅读(166) 评论(0) 推荐(0)

摘要：核苷酸：核苷酸是构成核酸（DNA和RNA）的基本组成单位。它是由三个组成部分组成：一个含氮碱基、一个五碳糖（核糖或脱氧核糖）和一个磷酸基团。在DNA中，四种碱基包括腺嘌呤（adenine，简称A）、鸟嘌呤（guanine，简称G）、胸腺嘧啶（thymine，简称T）和胞嘧啶（cytosine，简阅读全文

posted @ 2023-06-23 00:00 黑逍逍阅读(467) 评论(0) 推荐(0)

2023年6月22日

GWAS数据库

摘要： NHGRI-EBI GWAS数据库: https://www.ebi.ac.uk/gwas/ 描述：由美国国家人类基因组研究所（NHGRI）和欧洲生物信息研究所（EBI）合作建立的GWAS数据库，提供了公开可访问的GWAS关联结果和相关信息。 GRASP: http://grasp.nhlbi.ni 阅读全文

posted @ 2023-06-22 23:15 黑逍逍阅读(2235) 评论(0) 推荐(0)

2023年6月20日

曼哈顿图

摘要：纽约曼哈顿：曼哈顿图：曼哈顿图（Manhattan plot）是一种常用于基因组关联分析（GWAS）结果可视化的图表形式。它得名于其类似曼哈顿市天际线的形状。曼哈顿图以染色体上的位置为横轴，统计显著性（通常是负对数P值或-log10(P值)）为纵轴。每个SNP（单核苷酸多态性）或基因位点在曼哈阅读全文

posted @ 2023-06-20 23:55 黑逍逍阅读(1007) 评论(0) 推荐(0)

GLM/MLM/CMLM

摘要： GLM（Generalized Linear Model）、MLM（Mixed Linear Model）和CMLM（Compressed Mixed Linear Model）都是统计模型，常用于基因组关联分析（Genome-Wide Association Study，GWAS）中。 GLM（G 阅读全文

posted @ 2023-06-20 23:49 黑逍逍阅读(1679) 评论(0) 推荐(0)

tassel是什么

摘要： TASSEL（Trait Analysis by aSSociation, Evolution and Linkage）是一个用于遗传数据分析的开源软件套件。 TASSEL提供了一系列工具和算法，用于进行关联分析、群体结构分析、基因型-表型关联分析等。 TASSEL最初是由康奈尔大学开发的，旨在支持阅读全文

posted @ 2023-06-20 23:48 黑逍逍阅读(749) 评论(0) 推荐(0)

plink用法

摘要： https://www.cog-genomics.org/plink/ ./plink --file toy --freq --out toy_analysis ./plink --file 输入的文件名相应的处理 --out 输出的文件名阅读全文

posted @ 2023-06-20 23:39 黑逍逍阅读(116) 评论(0) 推荐(0)

plink这是啥

摘要： Plink（整体用大写字母 PLINK 表示）是一种用于进行遗传数据分析的开源软件。它是一个功能强大且广泛使用的工具，主要用于关联分析、基因型质量控制、遗传多样性分析、遗传模型拟合等。 Plink 最初是作为一个基因关联研究工具开发的，可以帮助研究人员在基因组数据中寻找与特定性状或疾病相关的基因变阅读全文

posted @ 2023-06-20 23:03 黑逍逍阅读(920) 评论(0) 推荐(0)

2023年6月19日

TWAS这是啥

摘要： TWAS（Transcriptome-Wide Association Study）全转录组关联分析思想：用于探索基因表达与复杂性状（如疾病风险）之间的关联。传统的GWAS（Genome-Wide Association Study）方法主要关注基因组中的遗传变异与疾病之间的关系，而TWAS则着阅读全文

posted @ 2023-06-19 23:29 黑逍逍阅读(727) 评论(0) 推荐(0)

wgcna这是啥

摘要： WGCNA（Weighted Gene Co-Expression Network Analysis）加权基因共表达网络分析 Gene：基因 Genome：基因组思想：将基因表达数据转化为基因共表达网络，其中每个基因是网络中的一个节点，而基因之间的共表达关系则用边连接。 WGCNA根据基因之间的阅读全文

posted @ 2023-06-19 23:22 黑逍逍阅读(416) 评论(0) 推荐(0)

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