2023年6月23日
摘要: ttps://www.jianshu.com/p/d31404620c9b https://github.com/genetics-statistics/GEMMA/releases Gemma是一个用于基因组关联分析(GWAS)的统计软件。Gemma(Genome-wide Efficient M 阅读全文
posted @ 2023-06-23 22:07 黑逍逍 阅读(1903) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 在GWAS(基因组关联研究)中,QQ plot(Quantile-Quantile plot,分位数-分位数图)是一种常用的统计图形,用于评估GWAS结果中的关联统计量是否偏离了预期的分布。 x轴:预期的P值分布的分位数。通常是以负对数刻度表示(-log10(P))。在QQ图上,x轴的数值范围从较小 阅读全文
posted @ 2023-06-23 21:19 黑逍逍 阅读(2291) 评论(0) 推荐(0)
摘要: cmplot是R语言中一个常用的生物信息学工具包(Bioconductor包),用于绘制基因共表达网络(co-expression network)中的模块(module)的图形展示。cmplot提供了一种简便的方式来可视化基因模块在不同条件或组之间的表达模式,帮助研究人员理解基因调控网络中的模式和 阅读全文
posted @ 2023-06-23 20:34 黑逍逍 阅读(173) 评论(0) 推荐(0)
摘要: PLINK文件格式是Plink软件使用的一种常见的文件格式,用于存储基因型数据和相关信息。PLINK文件格式包括两个主要文件:PED文件和MAP文件。 PED文件(.ped):PED文件是以纯文本形式存储的基因型数据文件,每一行表示一个个体的基因型信息。PED文件的每一列对应于一个基因座(SNP), 阅读全文
posted @ 2023-06-23 16:22 黑逍逍 阅读(1821) 评论(0) 推荐(0)
摘要: https://www.youtube.com/watch?v=7QMSZx3io-Q 阅读全文
posted @ 2023-06-23 15:19 黑逍逍 阅读(27) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 是指位于一对同源染色体相同位置上控制同一性状不同形态的基因 没懂 阅读全文
posted @ 2023-06-23 01:25 黑逍逍 阅读(172) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 核苷酸: 核苷酸是构成核酸(DNA和RNA)的基本组成单位。它是由三个组成部分组成:一个含氮碱基、一个五碳糖(核糖或脱氧核糖)和一个磷酸基团。 在DNA中,四种碱基包括腺嘌呤(adenine,简称A)、鸟嘌呤(guanine,简称G)、胸腺嘧啶(thymine,简称T)和胞嘧啶(cytosine,简 阅读全文
posted @ 2023-06-23 00:00 黑逍逍 阅读(498) 评论(0) 推荐(0)