黑逍逍 - 博客园

2023年6月27日

摘要： mysql -u your_username -p --default-character-set=utf8 your_database 连接数据库的时候就定义编码阅读全文

posted @ 2023-06-27 23:23 黑逍逍阅读(13) 评论(0) 推荐(0)

摘要： INSERT INTO my_table SELECT * FROM my_table; 这就可以了，几百万条，嘎嘎就创建好了 INSERT INTO my_table SELECT * FROM my_table LIMIT 100; 阅读全文

posted @ 2023-06-27 23:13 黑逍逍阅读(20) 评论(0) 推荐(0)

mysql常用命令

摘要：连接到 MySQL 服务器： mysql -u username -p 显示数据库列表： SHOW DATABASES; 创建数据库： CREATE DATABASE database_name; 删除数据库 USE database_name; DROP DATABASE database_nam 阅读全文

posted @ 2023-06-27 23:07 黑逍逍阅读(16) 评论(0) 推荐(0)

若要将 SQL 文件中的表导入到特定的数据库中，linux命令下

摘要：阅读全文

posted @ 2023-06-27 22:53 黑逍逍阅读(10) 评论(0) 推荐(0)

2023年6月24日

画qq图和曼哈顿图

摘要： https://www.youtube.com/watch?v=BKpZpA8WfcQ&list=PLaZuFfQk5gXPuXNA00R_uEfD422lmkSnr&index=6 用的GEWAS中example中的数据一、 qqman install.packages("qqman") lib 阅读全文

posted @ 2023-06-24 00:06 黑逍逍阅读(217) 评论(0) 推荐(0)

2023年6月23日

GEMMA安装和使用

摘要： ttps://www.jianshu.com/p/d31404620c9b https://github.com/genetics-statistics/GEMMA/releases Gemma是一个用于基因组关联分析（GWAS）的统计软件。Gemma（Genome-wide Efficient M 阅读全文

posted @ 2023-06-23 22:07 黑逍逍阅读(1825) 评论(0) 推荐(0)

QQplot

摘要：在GWAS（基因组关联研究）中，QQ plot（Quantile-Quantile plot，分位数-分位数图）是一种常用的统计图形，用于评估GWAS结果中的关联统计量是否偏离了预期的分布。 x轴：预期的P值分布的分位数。通常是以负对数刻度表示（-log10(P)）。在QQ图上，x轴的数值范围从较小阅读全文

posted @ 2023-06-23 21:19 黑逍逍阅读(2263) 评论(0) 推荐(0)

cmplot

摘要： cmplot是R语言中一个常用的生物信息学工具包（Bioconductor包），用于绘制基因共表达网络（co-expression network）中的模块（module）的图形展示。cmplot提供了一种简便的方式来可视化基因模块在不同条件或组之间的表达模式，帮助研究人员理解基因调控网络中的模式和阅读全文

posted @ 2023-06-23 20:34 黑逍逍阅读(159) 评论(0) 推荐(0)

PLINK文件格式

摘要： PLINK文件格式是Plink软件使用的一种常见的文件格式，用于存储基因型数据和相关信息。PLINK文件格式包括两个主要文件：PED文件和MAP文件。 PED文件（.ped）：PED文件是以纯文本形式存储的基因型数据文件，每一行表示一个个体的基因型信息。PED文件的每一列对应于一个基因座（SNP），阅读全文

posted @ 2023-06-23 16:22 黑逍逍阅读(1791) 评论(0) 推荐(0)

GWA in PLINK

摘要： https://www.youtube.com/watch?v=7QMSZx3io-Q 阅读全文

posted @ 2023-06-23 15:19 黑逍逍阅读(20) 评论(0) 推荐(0)

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