plink这是啥

Plink（整体用大写字母 PLINK 表示）是一种用于进行遗传数据分析的开源软件。

它是一个功能强大且广泛使用的工具，主要用于关联分析、基因型质量控制、遗传多样性分析、遗传模型拟合等。

Plink 最初是作为一个基因关联研究工具开发的，可以帮助研究人员在基因组数据中寻找与特定性状或疾病相关的基因变异。它支持处理大规模的遗传数据集，如单核苷酸多态性（SNP）数据。

Plink 提供了一系列命令行工具，包括数据预处理、数据格式转换、基因型质量控制、关联分析、基因型-表型关联分析等功能。它支持多种常见的遗传数据文件格式，如PED/MAP、BED/BIM/FAM、VCF 等。

除了常见的遗传数据分析功能外，Plink 还提供了一些高级功能，如群体结构分析、基因组相关性估计、遗传模型拟合、遗传连锁不平衡（LD）分析等。

 

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