生物信息与育种

摘要： [toc] > 徐扬老师综述得很到位，读完此文基本能对目前植物GS有个大概的了解。 ![Schematic-drawing-of-a-generalised-genomic-selection-strategy-showing-the-training.png](https://upload-ima 阅读全文

摘要： 这个问题网上已经有一堆回答了，如： [解决Jupyter-notebook不自动跳转浏览器的详细方法](https://zhuanlan.zhihu.com/p/435414400) [Python基础090：解决jupyter notebook无法自动跳转chrome浏览器的问题](https:/ 阅读全文

摘要： [【育种+俱乐部】2023第4期 西北农林安小鹏：奶山羊基因组育种液相芯片的研制及新品种培育](https://wx.vzan.com/live/page/1055811882?shauid=R7LDSUF2AcVCp0ZJZgKSRg**&vprid=0&sharetstamp=168612107 阅读全文

摘要： ## 环境依赖 ``` sudo yum update -y && \ yum groupinstall -y 'Development Tools' && \ yum install -y \ openssl-devel \ libuuid-devel \ libseccomp-devel \ w 阅读全文

摘要： 本地上传测序文件到Linux系统，做md5时发现有少数文件失败。 $ cat md5.check 84305_FDSW190448400-1a_1.fq.gz: OK 84305_FDSW190448400-1a_2.fq.gz: FAILED md5sum: WARNING: 1 computed 阅读全文

摘要： 最近在想，水稻起码已经测序了上万份材料，为什么还没有开发出一个像样的imputation panel？ 网上一查，实际上很多人有想过，有做过，也发表过高水平文章。 比如3K数据一发表，康奈尔大学的Susan McCouch就在NC上发表了panel及其imputation pipeline。 An 阅读全文

摘要： 登录 客户数据分享： 连接登录： sftp -o port=xxxx username@remote_ip 上传 上传文件 把本地服务器的/www/wwwroot目录下面的study.log文件上传到远程服务器的/www/server目录下。 sftp> lcd /www/wwwroot sftp> 阅读全文

摘要： 目标 输入矩阵 col.1 col.2 col.3 col.4 row.1 1 2 3 4 row.2 5 6 7 8 row.3 9 10 11 12 row.4 13 14 15 16 输出矩阵 col.1 col.2 col.3 col.4 row.1 1 2 3 4 row.2 0 6 7 阅读全文

摘要： 爱达荷大学的统计学顾问Julia Piaskowski总结的关于R包在农业研究领域应用的一个概括。 关于Julia Piaskowski：https://jpiaskowski.gitlab.io/ 来自agstats_2022_poster 更多信息： https://agstats.io/eve 阅读全文

摘要： 当我对两个基因型文件位置取交集，并重新生成两个vcf： $ bcftools view -R overlap.lst variant.filter.vcf.gz -Oz -o 300.vcf.gz 出现如下错误： $ tabix 300.vcf.gz [E::hts_idx_push] Unsort 阅读全文