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1、准备测试数据，8个样本，8个位点 [root@linuxprobe test]# cat outcome.ped DOR 1 0 0 0 -9 A G G G G G G C G G C C C C 0 0 DOR 2 0 0 0 -9 G G G G A G C C G G G C C C 0 阅读全文
posted @ 2020-10-10 20:58
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1、创建测试数据 [root@linuxprobe test]# cat a.txt ## 随机创建测试数据 fr dfg rte er hdf fgh dg fgd rtw er ewr scf yt ret tgr 2、简单用法 [root@linuxprobe test]# awk '$1 ~ 阅读全文
posted @ 2020-10-09 13:00
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1、准备测试数据10个样本，10个位点 [root@linuxprobe test]# ls test.map test.ped [root@linuxprobe test]# cat test.ped ## 10个样本，10行 DOR sample01 0 0 0 -9 G G C C G G G 阅读全文
posted @ 2020-10-07 00:44
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1、R语言seq函数用于生成一段步长相等的序列 简单用法： > seq(5) ##默认从1开始，默认步长为1，只跟一个数字默认是终点 [1] 1 2 3 4 5 > seq(6) [1] 1 2 3 4 5 6 > seq(5.6) [1] 1 2 3 4 5 2、设定起点 > seq(5) [1] 阅读全文
posted @ 2020-10-06 19:57
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1、创建测试数据 利用awk进行合并（1） [root@linuxprobe test2]# seq -w 30 | xargs -n 2 | sed = | sed 'N;s/\n/> /' > a.txt ##创建测试数据 [root@linuxprobe test2]# cat a.txt 1 阅读全文
posted @ 2020-10-06 15:34
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1、利用xargs命令将多列数据转化为一列数据 [root@linuxprobe test2]# echo "1 2 3 4 5 6" > a.txt [root@linuxprobe test2]# cat a.txt 1 2 3 4 5 6 [root@linuxprobe test2]# ca 阅读全文
posted @ 2020-10-06 14:57
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1、利用xargs进行行列转换 [root@linuxprobe test2]# seq 512345[root@linuxprobe test2]# seq 5 | xargs ## xargs 默认转化为1行1 2 3 4 5[root@linuxprobe test2]# seq 5000 | 阅读全文
posted @ 2020-10-06 13:54
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1、R语言中sort函数对向量按照从小到大排序，默认返回向量从小到大的值 创建测试数据： > test <- c(7,1,9,3,8)> test[1] 7 1 9 3 8> a <- sort(test) ## 默认升序> class(a) ## 返回值为数值[1] "numeric"> a[1] 阅读全文
posted @ 2020-10-06 00:10
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1、基本用法，直接运行date 显示系统当前时间 [root@linuxprobe test]# date Mon Oct 5 20:03:00 CST 2020 2、以特定格式输出，如“年-月-日 时:分:秒” [root@linuxprobe test]# date "+%Y-%m-%d %H: 阅读全文
posted @ 2020-10-05 20:42
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1、准备测试数据 [root@linuxprobe test]# ls test.map test.ped [root@linuxprobe test]# wc -l * ## 46827个位点，60个样本 46827 test.map 60 test.ped 46887 total [root@l 阅读全文
posted @ 2020-10-05 16:49
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