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2022年11月16日
linux 中实现将 每一行指定的最后一个出现的特定字符替换为指定字符
摘要: 001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 ab cd kk jj ee rr tt tt ss nn bb rr [root@pc1 test2]# rev a.txt | sed 's/ /_/' | r
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posted @ 2022-11-16 10:29 小鲨鱼2018
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2022年11月15日
python 中 循环结构同时传入多个参数
摘要: 001、 >>> list1 = [("aa",100, 400), ("bb", "kk", "yy"), (33, 400, 500)] >>> for i, j, k in list1: ## 利用列表、元组同时传入多个参数 ... print(i,k) ... aa 400 bb yy 33
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posted @ 2022-11-15 23:45 小鲨鱼2018
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python 中统计每一个字符串中每一个字符出现的次数
摘要: 001、 直接使用字典进行统计 >>> str1 = "aaaabbcdddefff" ## 测试字符串 >>> dict1 = dict() >>> for i in str1: ## 利用条件分支进行判断 ... if i in dict1: ... dict1[i] += 1 ... else
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posted @ 2022-11-15 23:34 小鲨鱼2018
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Python 中的 defaultdict 数据类型
摘要: 首先,defaultdict 是 dict 的一个子类。通常 Python 中字典(dict)是通过键值对来存取的,当索引一个不存在的键时,就会引发 keyerror 异常。那么,defaultdict 就可以解决这个问题,它可以实现为不存的键值返回一个默认值。 defaultdict是 colle
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posted @ 2022-11-15 23:24 小鲨鱼2018
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python 中 filter函数的用法
摘要: 和map()类似,filter()也接收一个函数和一个序列。和map()不同的时,filter()把传入的函数依次作用于每个元素,然后根据返回值是True还是False决定保留还是丢弃该元素。 >>> def is_odd(n): ... return n % 2 == 1 ... >>> filt
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posted @ 2022-11-15 22:48 小鲨鱼2018
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python 中内建函数map的用法
摘要: map函数会根据提供的函数对指定序列做映射。 通过定义可以看到,这个函数的第一个参数是一个函数,剩下的参数是一个或多个序列,返回值是一个集合。 map的作用是以参数序列中的每一个元素调用function函数,返回包含每次function函数返回值 001、 >>> map(lambda x: x *
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posted @ 2022-11-15 22:41 小鲨鱼2018
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2022年11月14日
python 中 #-*-coding: UTF-8 -*-的作用
摘要: #-*-coding: UTF-8 -*- 解决python2 中 中文乱码报错的问题 001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试数据 >chr1 xxx aaaggg eeee >chr2 yyy
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posted @ 2022-11-14 12:18 小鲨鱼2018
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python 中实现在命令行中传递参数
摘要: 001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 kkk aattttt cccc >chr2 yyy ttttuuuu ddfff >chr3 eee uuuuukk sssff
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posted @ 2022-11-14 12:00 小鲨鱼2018
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2022年11月12日
python 中统计fasta文件中每条scaffold中碱基的数目
摘要: 001、 [root@pc1 test2]# ls a.fa test.py [root@pc1 test2]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 aattggggc ssff xx >chr2 uuuttcccccc >chr3 ggggcccc tttt [root@pc1
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posted @ 2022-11-12 18:01 小鲨鱼2018
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linux 中shell 脚本将 gff文件转换为bed文件
摘要: 001、 [b20223040323@admin1 test]$ ls ## 测试gff文件 exons_only.gff [b20223040323@admin1 test]$ gff2bed <exons_only.gff > exons_only.bed ## gff2bed模块转换 Warn
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posted @ 2022-11-12 17:07 小鲨鱼2018
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