小鲨鱼2018

2023年5月15日

摘要： 001、python版本和 pip版本 a、python版本 [root@PC1 pip]# python --version Python 3.11.3 b、pip版本 [root@PC1 Python-3.11.3]# pip --version pip 23.1.2 from /usr/lo 阅读全文

posted @ 2023-05-15 23:11 小鲨鱼2018 阅读(73) 评论(0) 推荐(0)

ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

摘要： 001、在利用python2.7环境下利用pip安装pyfaidx模块时报如下错误： ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command out 阅读全文

posted @ 2023-05-15 23:00 小鲨鱼2018 阅读(1411) 评论(0) 推荐(0)

bash: pip: command not found...

摘要： python2.7中安装pip命令 001、 [root@PC1 test]# pip bash: pip: command not found... 002、 [root@PC1 test]# cat /etc/redhat-release 003、 [root@PC1 software]# cu 阅读全文

posted @ 2023-05-15 13:20 小鲨鱼2018 阅读(57) 评论(0) 推荐(0)

seqkit 软件的安装

摘要： 001 下载静态软件 wget https://github.com/shenwei356/seqkit/releases/download/v2.4.0/seqkit_linux_amd64.tar.gz 002、解压 tar -xzvf seqkit_linux_amd64.tar.gz 003 阅读全文

posted @ 2023-05-15 12:43 小鲨鱼2018 阅读(806) 评论(0) 推荐(0)

Linux 系统中 2>&1 & 标准输出、标准错误输出

摘要： 2>&1 & 0：标准输入 1：标准输出 2：标准错误输出 command 2>&1 > file.txt：将标准输出输出到file中，标准错误输出输出屏幕 command > file.txt 2>&1：将标准错误输出输出到标准输出中。 command 2> error.txt 1> righ 阅读全文

posted @ 2023-05-15 00:37 小鲨鱼2018 阅读(915) 评论(0) 推荐(0)

2023年5月14日

pscp命令实现windows和linux之间文件的网络互传

摘要： pscp属于putty软件下的命令。 001、从远端传输至本地 pscp root@192.168.254.130:/home/test/a.txt C:\Users\ljx\Desktop 002、从本地上传至远端 pscp C:\Users\ljx\Desktop\b.txt root@192. 阅读全文

posted @ 2023-05-14 23:59 小鲨鱼2018 阅读(89) 评论(0) 推荐(0)

NCBI中根据sra号下载数据

摘要： 001、如果可行，最方便，直接生成fastq格式数据 fastq-dump --split-files SRR1770413 002、 a、下载sra格式数据 prefetch SRR1770413 b、转换为fastq格式 fastq-dump --gzip --split-files SRR1 阅读全文

posted @ 2023-05-14 23:32 小鲨鱼2018 阅读(151) 评论(0) 推荐(0)

2023年5月13日

linux 中如何提取最后一列或者最后若干列之外的所有内容

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 阅读全文

posted @ 2023-05-13 22:16 小鲨鱼2018 阅读(129) 评论(0) 推荐(0)

linux 中字符串的截取

摘要： 001、从头向前，最短删除 [root@PC1 test]# var=GCF_000001735.4_TAIR10.1_genomic.fna [root@PC1 test]# echo $var GCF_000001735.4_TAIR10.1_genomic.fna [root@PC1 test 阅读全文

posted @ 2023-05-13 21:53 小鲨鱼2018 阅读(170) 评论(0) 推荐(0)

linux 中批量删除文件后缀

摘要： 001、rename [root@PC1 test]# ls 1.csv 2.csv 3.csv a.txt b.txt c.txt [root@PC1 test]# rename ".txt" "" *.txt ## 删除.txt后缀 [root@PC1 test]# ls 1.csv 2.csv 阅读全文

posted @ 2023-05-13 21:29 小鲨鱼2018 阅读(693) 评论(0) 推荐(0)

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