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2023年6月10日
python中指定fasta文件中碱基每行以指定数目输出
摘要: 001、 [root@PC1 test2]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 aattccgggttgggcccyujjjttt ddeeeegghggii >chr2 8883dsfdkkkfftteeessskkk aaadddfffgggcccgggt33 ddggee
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posted @ 2023-06-10 00:18 小鲨鱼2018
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2023年6月8日
python 中输出匹配字符串及其下一行
摘要: 001、 [root@PC1 test05]# ls a.txt test.py [root@PC1 test05]# cat a.txt ## 测试数据 3333 gene 9999 kkkk gene 7777 8888 gene gene 0000 6666 [root@PC1 test05]
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posted @ 2023-06-08 21:17 小鲨鱼2018
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python中调整字符串的宽度,设置填充值
摘要: 001、 >>> str1 = "ab" ## 测试字符串 >>> str1 'ab' >>> str1.ljust(10) ## 调整宽度为10, 左侧对齐, 默认用空格填充 'ab ' >>> str1.ljust(10, "+") ## 设置用+号填充 'ab++++++++' >>> str
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posted @ 2023-06-08 20:52 小鲨鱼2018
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python 中 将列表中的数值转换为字符串
摘要: 001、 >>> list1 = [111, 222, 333] >>> list1 [111, 222, 333] >>> list1 = [str(i) for i in list1] ## 将列表中数值转换为字符串 >>> list1 ['111', '222', '333']
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posted @ 2023-06-08 20:35 小鲨鱼2018
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linux 中awk 命令输出匹配字符及其下一行
摘要: 001、 [root@PC1 test04]# ls a.txt [root@PC1 test04]# cat a.txt ## 测试数据 3333 gene 9999 kkkk gene 7777 8888 gene gene 0000 6666 ## 输出匹配字符及其下一行 [root@PC1
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posted @ 2023-06-08 18:28 小鲨鱼2018
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linux 中sed命令输出匹配字符的下一行
摘要: 001、 [root@PC1 test04]# ls a.txt [root@PC1 test04]# cat a.txt ## 测试数据 3333 gene 9999 kkkk gene 7777 8888 gene 0000 6666 [root@PC1 test04]# sed -n '/ge
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posted @ 2023-06-08 18:15 小鲨鱼2018
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linux 中 awk命令 getline输出匹配字符的下一行
摘要: 001、 [root@PC1 test04]# ls a.txt [root@PC1 test04]# cat a.txt ## 测试数据 3333 gene 9999 kkkk gene 7777 8888 gene 0000 6666 [root@PC1 test04]# awk '$1 ==
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posted @ 2023-06-08 18:10 小鲨鱼2018
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linux 中awk命令实现从gff文件中排除pseudogene信息
摘要: 001、 [b20223040323@admin2 test]$ ls a.gff [b20223040323@admin2 test]$ cat a.gff region 1 pseudogene 2 transcript 3 exon 4 pseudogene 5 transcript 6 ex
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posted @ 2023-06-08 00:33 小鲨鱼2018
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2023年6月7日
python 中统计指定字符串出现的次数
摘要: 001、 >>> str1 = "abcdaaab" ## 测试字符串 >>> str1.count("a") ## 统计a出现的次数 4 >>> str1.count("b") 2 >>> str1.count("c") 1 >>> str1.count("a", 0, 4) ## 可以指定统计字
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posted @ 2023-06-07 23:19 小鲨鱼2018
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python 中字符串大小写的转换
摘要: 001、全部转换为大写、或者全部转换为小写 >>> str1 = "abcDEFgh" >>> str1.lower() ### 小写 'abcdefgh' >>> str1.upper() ## 大写 'ABCDEFGH' >>> str1 'abcDEFgh' >>> str1.casefold
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posted @ 2023-06-07 22:34 小鲨鱼2018
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