R语言 - 随笔分类(第3页) - 小鲨鱼2018

R语言中安装 maptools 包

摘要：001、R语言中安装maptools出现如下问题： > install.packages("maptools") 将程序包安装入‘C:/Users/liujiaxin/AppData/Local/R/win-library/4.3’ (因为‘lib’没有被指定) Warning in install 阅读全文

posted @ 2024-05-22 23:58 小鲨鱼2018 阅读(3710) 评论(2) 推荐(1)

ERROR: dependency 'sp' is not available for package 'rgdal'

摘要：001、R包安装出错如下： ERROR: dependency 'sp' is not available for package 'rgdal' 002、解决方法： install.packages("sp") 。阅读全文

posted @ 2024-05-22 22:23 小鲨鱼2018 阅读(660) 评论(0) 推荐(0)

R语言中安装 rgdal 包

摘要：001、R语言中安装 rgdal 出现如下报错 > install.packages("rgdal") 将程序包安装入‘C:/Users/liujiaxin/AppData/Local/R/win-library/4.3’ (因为‘lib’没有被指定) Warning in install.pack 阅读全文

posted @ 2024-05-22 22:11 小鲨鱼2018 阅读(4137) 评论(1) 推荐(1)

R语言中如何抽取向量的偶数项或者奇数项

摘要：001、 R语言中如何抽取向量的偶数项或者奇数项 > a <- letters[1:10] ## 生成一个测试向量 > a [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" > a[seq(1, length(a), 2)] ## 提取奇数项 [1] "a" " 阅读全文

posted @ 2024-05-20 19:30 小鲨鱼2018 阅读(328) 评论(0) 推荐(0)

R语言中根据列明调整数据框中数据的顺序

摘要：001、R语言中根据列明调整数据框中数据的顺序 > a <- 1:4 > b <- 11:14 > c <- letters[1:4] > d <- LETTERS[1:4] > e <- LETTERS[4:1] > dat <- data.frame(b,c,a,e,d) ## 测试数据框 > 阅读全文

posted @ 2024-05-20 19:28 小鲨鱼2018 阅读(103) 评论(0) 推荐(0)

R语言中根据列名删除指定的列

摘要：001、 subset函数 > a <- 1:4 > b <- 4:1 > c <- 11:14 > d <- 14:11 > e <- letters[1:4] > dat <- data.frame(a, b, c, d, e) ## 测试数据框 > dat a b c d e 1 1 4 11 阅读全文

posted @ 2024-05-20 10:52 小鲨鱼2018 阅读(441) 评论(0) 推荐(0)

R语言中绘图设置不输出绘图内容

摘要：001、正常绘图 plot(1:10, cex = 2, pch = 19) 002、不输出绘图内容 plot(1:10, cex = 2, pch = 19, type = "n") 。阅读全文

posted @ 2024-05-17 23:16 小鲨鱼2018 阅读(59) 评论(0) 推荐(0)

R语言中绘图不输出x轴或者y轴的刻度标签

摘要：001、正常绘图 plot(1:10, cex = 2, pch = 19) 002、不输出x轴刻度标签 plot(1:10, cex = 2, pch = 19, xaxt = "n") 。 reference 01、https://www.cnblogs.com/shclbear/p/17253 阅读全文

posted @ 2024-05-17 23:05 小鲨鱼2018 阅读(142) 评论(0) 推荐(0)

R语言中plot绘图只输出内容，不输出框线、标签

摘要：001、正常绘图 > plot(1:10, cex = 2, pch = 19) 002、只输出绘图内容 > plot(1:10, cex = 2, pch = 19, axes = F) 。 reference 01、https://www.cnblogs.com/shclbear/p/17253 阅读全文

posted @ 2024-05-17 22:58 小鲨鱼2018 阅读(58) 评论(0) 推荐(0)

R语言中判断数值是否带有小数点

摘要：001、不为整数 > a <- 5.324 > floor(a) == a ## 截断后不相等，说明带有小数点部分，即不为整数 [1] FALSE 002、是整数 > b <- 324 > floor(b) == b ## 截断小数点后仍然相等，说明是整数 [1] TRUE 。阅读全文

posted @ 2024-05-17 22:33 小鲨鱼2018 阅读(61) 评论(0) 推荐(0)

R语言中小数点如何实现进位

摘要：001、round，四舍五入 > a <- 5.345 ## 舍去 > round(a) [1] 5 > b <- 5.824 ## 进位 > round(b) [1] 6 002、round，四舍五入指定小数位数 > a <- 8.426532 > round(a, 1) ## 保留一位小数，四舍阅读全文

posted @ 2024-05-17 22:22 小鲨鱼2018 阅读(81) 评论(0) 推荐(0)

R语言中如何将科学计数法转换为数值型

摘要：001、测试 a <- c("1.23e-2", "7.56207e-05", "6.86470e-05") as.numeric(a) ## 直接转换为数值类型，然而并不起作用 02、增加参数(全局使用） options(scipen = 100) ## 小数点后100位不适用科学计数法 b < 阅读全文

posted @ 2024-05-13 11:37 小鲨鱼2018 阅读(1262) 评论(0) 推荐(0)

R语言中取色器 colorfindr测试

摘要：需求：一张图片，想知道到底是什么颜色，在R语言中的颜色系统中。测试图片如下： 001、 install.packages("colorfindr") ## 安装包 library("colorfindr") ## 加载包 get_colors( img = "aa.png", min_shar 阅读全文

posted @ 2024-04-29 15:07 小鲨鱼2018 阅读(121) 评论(0) 推荐(0)

R 语言中取色器

摘要：001、 https://palettegenerator.com/ https://www.jianshu.com/p/52f0764179d9 阅读全文

posted @ 2024-04-29 12:05 小鲨鱼2018 阅读(42) 评论(0) 推荐(0)

ggplot 中绘图设置轴标签和标题与绘图区域的间距

摘要：001、基础绘图 library(ggplot2) p <- ggplot(faithful, aes(x = eruptions, y = waiting)) + geom_point() p 002、调整标签刻度到绘图区域的间距 p + theme(axis.text.x = element_ 阅读全文

posted @ 2024-04-17 11:55 小鲨鱼2018 阅读(952) 评论(0) 推荐(0)

R语言中pch对照表

摘要：R语言中pch对照表：。阅读全文

posted @ 2024-04-10 20:49 小鲨鱼2018 阅读(233) 评论(0) 推荐(0)

R语言中barplot绘图设置不同分组之间的间距

摘要：001、 a <- sample(20:80,15) a b <- matrix(a,nrow=3) b par(mfrow = c(2, 1)) barplot(b,width=1,beside=T, space = c(0, 2), main = "xxx") barplot(b,width=1 阅读全文

posted @ 2024-04-10 20:32 小鲨鱼2018 阅读(104) 评论(0) 推荐(0)

linux 系统中可以这样安装指定版本的R

摘要：软件包安装： 001、系统 [root@localhost test01]# cat /etc/redhat-release ## 系统 CentOS Linux release 8.4.2105 。 002、安装epel软件源 [root@localhost test01]# yum instal 阅读全文

posted @ 2024-04-04 21:56 小鲨鱼2018 阅读(465) 评论(0) 推荐(0)

R语言中为什么后者比前者快这么多？？

摘要：前者：for (row in 1:nrow(gterms)) { gene_terms <- str_split(gterms[row,"GOs"], ",", simplify = FALSE)[[1]] gene_id <- gterms[row, "query"][[1]] tmp <- da 阅读全文

posted @ 2024-03-25 23:10 小鲨鱼2018 阅读(33) 评论(0) 推荐(0)

R语言中shapply、unlist函数的应用

摘要：R语言中sappy、unlist函数的应用 gene_to_go <- data.frame(gene = rep(gene_ids[eggnog_lines_with_go], times = sapply(eggnog_annoations_go, length)), term = unlist 阅读全文

posted @ 2024-03-25 23:07 小鲨鱼2018 阅读(46) 评论(0) 推荐(0)

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