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jcfaieng
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2022年4月13日
GEO数据分析中exprs提取表达矩阵,pData提取临床信息(R)
摘要: 转载自 https://www.jianshu.com/p/9b1a1bda4ca5
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posted @ 2022-04-13 17:21 jcfaieng
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2022年3月23日
如何查看CPU的使用率或占用率
摘要: 方法一、使用Windows+R组合键,打开运行窗口,输入taskmgr.exe,输入完成后点击“确定”。 方法二、在下方任务栏位置,点击鼠标右键,打开“任务管理器”。 任务管理器打开方法参照上述方法,打开后通过下图所示未知即可查看CPU使用率。 点击“进程”查看具体的任务占领的CPU使用率。
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posted @ 2022-03-23 20:10 jcfaieng
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2022年3月19日
查询基因和甲基化位点的关系
摘要: DiseaseMeth:人类疾病甲基化数据库 http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/diseasemeth/ 讲解:https://zhuanlan.zhihu.com/p/339160446 MethHC: 人类癌症甲基化数据库 http://methhc.mbc.nct
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posted @ 2022-03-19 20:00 jcfaieng
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2021年6月4日
基因结构
摘要: 本文转载自 基因结构 - 知乎 (zhihu.com) 我们都知道不论真核与原核生物都离不开基因,它储存着生长、发育、凋亡等几乎全部生命过程的信息。那么基因有着哪些结构呢,接下来从三个层面来讨论基因的构成: 一、DNA 编码区 Coding region 基因在结构上,分为编码区和非编码区两部分。真
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posted @ 2021-06-04 13:41 jcfaieng
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2021年5月29日
UCSC基因位置信息
摘要: table genePred"A gene prediction."(string name: "Name of gene" //基因名称string chrom: "Chromosome name" //染色体名称char[1] strand: "+ or - for strand" //正负链信
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posted @ 2021-05-29 14:41 jcfaieng
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2021年4月30日
TCGA-DB
摘要: 》TCGA条形码 TCGA-02-0001-01C-01D-0182-01 项目名称 --> 组织来源中心 -->科研参与者 -->(01-09癌症,10-19正常,20-29control)+ 此样本从哪个瓶中取 --> 对上一步瓶中样本再次分+分子分析类型(D-DNA测序) --> 检测平板的孔
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posted @ 2021-04-30 14:59 jcfaieng
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2021年4月24日
R-bioMart包
摘要: bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口,能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库 这个·包可以做以下几个工作 1.查找某个基因在染色体上的位置。反之,给定染色体每一区间,返回该区间的基因s; 2.通过EntrezGene的ID查找到相关序列的GO注释。反之,给定相关的GO注
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posted @ 2021-04-24 22:26 jcfaieng
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加载org.Hs.eg.db包失败问题
摘要: org.Hs.eg.db安装成功,但加载时失败: 先运行options(connectionObserver = NULL)命令,后继续加载此包可成功
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posted @ 2021-04-24 18:20 jcfaieng
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2021年4月23日
R语言字符串去引号
摘要: 有的时候我们将某字符串代入函数时需要去掉引号,比如:"ABCA1"中我们只需要用到ABCA1,此时我们可直接用as.name函数去掉引号 实例:
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posted @ 2021-04-23 14:15 jcfaieng
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Gene mutation相关database
摘要: 1. HGMD(The Human Gene Mutation Database)http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php 这个数据库全面收集了引起人类遗传疾病或与人类遗传疾病相关的细胞核基因突变信息,信息相对较全,但注册必须使用官方邮箱 HGMD收集的数据包括了单
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posted @ 2021-04-23 10:02 jcfaieng
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