TCGA-DB
》TCGA条形码
TCGA-02-0001-01C-01D-0182-01
项目名称 --> 组织来源中心 -->科研参与者 -->(01-09癌症,10-19正常,20-29control)+ 此样本从哪个瓶中取 --> 对上一步瓶中样本再次分+分子分析类型(D-DNA测序) --> 检测平板的孔的序号 -- 测序中心代码
正常用前四个就行
》TCGA癌症类型
计33种,包括10种稀有癌症
》数据类型
临床信息 组织影像 DNA测序 miRNA测序 mRNA测序 蛋白表达数据(用的少) 甲基化 拷贝数
》数据水平
level1: 原始数据
level2: 处理过的数据(去噪)-可以有
level3: 经过分割、解释的数据(整合数据)-level2和3用前读数据说明,看他前期如何处理,是否符合需要
level4: 感兴趣的区域或概要-可用性不大
》数据下载
具体后续在补充...

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