TCGA-DB

》TCGA条形码

  TCGA-02-0001-01C-01D-0182-01

  项目名称 --> 组织来源中心 -->科研参与者 -->(01-09癌症,10-19正常,20-29control)+ 此样本从哪个瓶中取 --> 对上一步瓶中样本再次分+分子分析类型(D-DNA测序) --> 检测平板的孔的序号 -- 测序中心代码

  正常用前四个就行

》TCGA癌症类型

  计33种,包括10种稀有癌症

》数据类型

  临床信息  组织影像  DNA测序  miRNA测序  mRNA测序  蛋白表达数据(用的少)  甲基化  拷贝数

》数据水平

  level1: 原始数据

  level2: 处理过的数据(去噪)-可以有

  level3: 经过分割、解释的数据(整合数据)-level2和3用前读数据说明,看他前期如何处理,是否符合需要

  level4: 感兴趣的区域或概要-可用性不大

》数据下载

  具体后续在补充...

  

posted @ 2021-04-30 14:59  jcfaieng  阅读(117)  评论(0)    收藏  举报