R-bioMart包
bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口,能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库
这个·包可以做以下几个工作
1.查找某个基因在染色体上的位置。反之,给定染色体每一区间,返回该区间的基因s;
2.通过EntrezGene的ID查找到相关序列的GO注释。反之,给定相关的GO注释,获取相关的EntrezGene的ID;
3.通过EntrezGene的ID查找到相关序列的上游100bp序列(可能包含启动子等调控元件);
4.查找人类染色体上每一段区域中已知的SNPs;
5.给定一组的序列ID,获得其中具体的序列;
这个·包可以做以下几个工作
1.查找某个基因在染色体上的位置。反之,给定染色体每一区间,返回该区间的基因s;
2.通过EntrezGene的ID查找到相关序列的GO注释。反之,给定相关的GO注释,获取相关的EntrezGene的ID;
3.通过EntrezGene的ID查找到相关序列的上游100bp序列(可能包含启动子等调控元件);
4.查找人类染色体上每一段区域中已知的SNPs;
5.给定一组的序列ID,获得其中具体的序列;
详细信息链接:https://www.jianshu.com/p/72ee40bed5b4

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