emanlee - 博客园

2021年3月8日

摘要：使用SRAdb V2获取SRA数据安装SRAdbV2包install.packages('BiocManager')BiocManager::install('seandavi/SRAdbV2')使用SRAdbV2 首先需要创建一个 R6类-Omicidx library(SRAdbV2)oidx 阅读全文

posted @ 2021-03-08 20:39 emanlee 阅读(386) 评论(0) 推荐(0)

Sequence Read Archive (SRA)

摘要： The Sequence Read Archive (SRA) is an archive for high throughput sequencing data, publically accessible, for the purpose of enhancing reproducibility 阅读全文

posted @ 2021-03-08 20:07 emanlee 阅读(481) 评论(0) 推荐(0)

SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame

摘要： pandas df: new_df['tissue'] = new_df['tissue'].str.lower() <ipython-input-24-d2fb04c89c2a>:1: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a 阅读全文

posted @ 2021-03-08 09:15 emanlee 阅读(662) 评论(0) 推荐(0)

2021年3月7日

安装 TFLearn

摘要：确保 tensorflow 成功安装 conda install numpy pandas jupyter notebook matplotlibconda install scipy h5pypip install TFLearn 阅读全文

posted @ 2021-03-07 22:07 emanlee 阅读(173) 评论(0) 推荐(0)

Pandas

摘要： Dataframe & Series Columns & Index Missing values: NaN df.index df.columns df.data type(...) df.dtypes series.to_frame() s.value_counts() s.describe() 阅读全文

posted @ 2021-03-07 21:40 emanlee 阅读(79) 评论(0) 推荐(0)

python open file, TypeError: an integer is required (got type str)

摘要： file_object = open( 'ssue.csv', 'w', 'utf-8') TypeError: an integer is required (got type str)对于第三个参数，指定编码方式必须要加encoding=“utf-8” read_helper=open(chec 阅读全文

posted @ 2021-03-07 14:52 emanlee 阅读(1518) 评论(0) 推荐(0)

2021年3月6日

readline() UnicodeDecodeError: 'gbk' codec can't decode byte 0xbd in position 7265: illegal multibyte sequence

摘要： readline() UnicodeDecodeError: 'gbk' codec can't decode byte 0xbd in position 7265: illegal multibyte sequence 解决方法将 open(class_file_name, 'r') 改为 op 阅读全文

posted @ 2021-03-06 21:51 emanlee 阅读(389) 评论(0) 推荐(0)

常用物种拉丁文名称

摘要： Homo sapiens (human，人) Mus musculus (mouse，小鼠) Rattus norvegicus (rat，大鼠) Xenopus laevis (frog，爪蟾) Drosophila melanogaster (fruit fly，果蝇) Caenorhabdit 阅读全文

posted @ 2021-03-06 08:22 emanlee 阅读(41043) 评论(0) 推荐(0)

2021年3月5日

oracle 更新行号使用行号更新Oracle表列

摘要： UPDATE tablename SET id = ROWNUM; 阅读全文

posted @ 2021-03-05 21:34 emanlee 阅读(467) 评论(0) 推荐(0)

oracle 如何设置主键自增（自增长字段）

摘要： oracle有点麻烦，需要使用序列和触发器达到目的。具体步骤如下：一、创建数据表create table AAA_employee(Id int ,DeptNo number,EmpNo number,Ename varchar2(16),Job varchar2(32),Sal float,Hir 阅读全文

posted @ 2021-03-05 20:19 emanlee 阅读(1226) 评论(0) 推荐(0)