冬梅

摘要： BiocManager::install("bcellViper", version = "3.18") #先安装依赖包 #github下载/public/home/chidm/Downloads/dorothea-master.zip # 1 .zip转化为.tar.gz cd /public/h 阅读全文

摘要： # 参考：https://mp.weixin.qq.com/s/YTO02blpdAi0PTI63TNtjA， ##高分杂志同款cellchat细胞通讯结果气泡图绘制 library(Seurat) library(tidyverse) library(CellChat) library(NMF) 阅读全文

摘要： #### 1. IOBR有一系列安装包 #### ## 1.1 利用library检查包是否已安装（in-house) # 获取所有未安装的包，并将它们输出为 c() 的格式： depens <- c('tibble', 'survival', 'survminer', 'limma', 'DESe 阅读全文

摘要： 定义包列表 depens <- c('tibble', 'survival', 'survminer', 'limma', 'DESeq2', 'devtools', 'limSolve', 'GSVA', 'e1071', 'preprocessCore', 'tidyHeatmap', 'car 阅读全文

摘要： 转自：https://mp.weixin.qq.com/s/-9zh8euU89eBbv3k-qV7IA 包括：CIBERSORT，ESTIMATE，quanTIseq，TIMER，IPS，MCP-counter，xCell，EPIC IBOR包 参考教程： https://cloud.tencen 阅读全文

摘要： ### liana安装 #### ## 1 github官方安装 liana， 失败 # remotes::install_github("saezlab/liana") ## 2 手动下载，本地安装，失败 # 手动下载 # https://ghfast.top/ #下载地址 # https://g 阅读全文

摘要： 查看包依赖关系： 1.在更新包之前，使用以下命令查看包的依赖： tools::package_dependencies("包名", db = installed.packages()) 这可以帮助你了解哪些包依赖于你要更新的包。 2.使用虚拟环境： 类似于Python的virtualenv，你可以使 阅读全文

摘要： # 参考1：https://github.com/digitalcytometry/cytotrace2?tab=readme-ov-file # 参考2：http://www.360doc.com/content/24/0426/09/65403234_1121488444.shtml devto 阅读全文

摘要： https://mp.weixin.qq.com/s/hlK1BB97giRpZAq9YvUKpQ 阅读全文

摘要： ###### ssGSEA ############## #加载18条神经通路合集 load("./score/ssGSEA/geneset_list_18.RData") geneset_list select_pathway_name <- c("G_protein_coupled_ACh_re 阅读全文