摘要：
1.BiocManager 除非指定某版本BiocManger，可不指定BioManager版本 install.packages("BiocManager") library(BiocManager) BiocManager::install() 指定BiocManger版本： if (!requ 阅读全文
posted @ 2024-03-17 15:13
corrschi
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特别好用的工具RISmed包：可批量查询、获取、分析pubmed的文章，它很好的对接pubmed功能，可根据MESH、title、abstract、author等进行查询。 使用这个RISmed包需要先安装ggplot2，RColorBrewer，ggsci,因为在可视化的过程中需要用到。 1.R4 阅读全文
posted @ 2024-03-16 23:01
corrschi
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1.使用conda安装tidyverse conda install -c conda-forge r-tidyverse 2.安装后R版本较旧，conda版本新安装的tidyverse较新，启动后导致tidyverse的许多依赖包版本冲突。 解决问题过程中涉及R包的卸载，安装，镜像设置和重新安装加 阅读全文
posted @ 2024-03-16 22:21
corrschi
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1.检查rlang是否在其他窗口被加载 2.该命令安装包处一定要加引号，不加引号会报错。 解决如下： remove.packages("rlang") 3.重新安装rlang包后，注意重启R一下。如不重启，可能仍旧报错。 阅读全文
posted @ 2024-03-16 21:45
corrschi
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这篇文章转自主要介绍了服务器端jupyter notebook映射到本地浏览器的操作， 做科研经常有这样的需求：即需要借助服务器的计算资源，本地编辑的工程文件需要每次都传到服务器才能运行。jupyter是较好的交互式编辑工具，有没有一种方式可以在jupyter上编辑属于服务器的文件呢？这就引出了我们 阅读全文
posted @ 2024-03-16 21:24
corrschi
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1.打开命令行工具，输入以下命令，创建一个新的 conda 环境并激活： conda create -n myenv r-base==4.2.2 conda activate myenv 如碰到PackagesNotFoundError问题解决，使用以下命令，将conda-forge通道添加到通道列 阅读全文
posted @ 2024-03-16 21:10
corrschi
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#1 安装 1.登录root账户 2.yum install screen #使用yum安装screen 3.测试安装是否成功： 1）安装成功后会显示complicated 2)使用screen -h或man screen测试 #2 常用命令 创建新的窗口：screen -S windowname 阅读全文
posted @ 2024-03-16 20:17
corrschi
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摘要：
使用以下命令，将conda-forge通道添加到通道列表中： conda config --append channels conda-forge 它告诉conda在搜索包时也要查看conda-forge通道。 然后，就可以简单地使用conda install r-base=version了， 例如 阅读全文
posted @ 2024-03-16 20:04
corrschi
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