随笔分类 - 技术推介
摘要：H3K36me2重编程调控谱系特异性植入后的de novo DNA甲基化。
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摘要：大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化作为表观遗传调控的重要机制，在肿瘤发生、发展及预后中发挥关键作用。TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据库作为全球最大的肿瘤数据库，包含了全基因组甲基化芯片数据，主要涵盖Illumina 450K（H
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摘要：涵盖人类/大鼠/小鼠等哺乳动物、细菌、植物等全物种范围服务 大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化作为表观遗传调控的核心机制，通过不改变DNA序列的方式影响基因功能，在发育、疾病等生命过程中发挥关键作用。Oxford Nanopore Technologies（
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摘要：大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 m5C是RNA百余种修饰中研究较多的一种。m5C存在于tRNA上时，可以对翻译进行调节；存在于rRNA上时，可以对核糖体的生物合成进行质控；存在于mRNA上时，则可以影响mRNA的结构、稳定性及翻译过程。 m5C RNA修饰的检测，易基
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摘要：大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。今天跟大家介绍一下易基因的新产品：细菌全基因组甲基化纳米孔测序（ONT）。 表观修饰不需要改变DNA序列便能实现对性状的改变，表观修饰的改变与基因功能乃至细胞状态、发育、衰老、疾病等存在重要的关联。在众多的表观遗传修饰中，最为重要且研究最为
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摘要：大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）是甲基化研究的重要技术。尽管已经开发了一系列工具来解决由亚硫酸盐处理引起的比对问题，但尚未对最新可用工具的reads比对性能以及多种哺乳动物的生物学解释（biological interpretatio
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摘要：大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 本期，我们讲讲精准简化基因组甲基化测序（RRBS+oxRRBS）怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等方面详细介绍。 一、精准简化基因组甲基化测序(RRBS+oxRRBS)技术概述 5-羟甲基化胞嘧啶（5hmC）是甲基化胞嘧啶（
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摘要：大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2022年9月30日，南京农业大学动物科技学院钟翔教授团队在《ANTIOXIDANTS-BASEL》杂志发表题为“m6A RNA Methylation Mediates NOD1/NF-kB Signaling Activation
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摘要：N7-甲基鸟苷（N7-methylguanosine，m7G）是真核生物tRNA、rRNA和mRNA 5'cap中最丰富的修饰之一。作为一种重要的表观遗传修饰，m7G RNA甲基化在基因表达、加工代谢、蛋白质合成、转录稳定等方面发挥着重要的作用，参与疾病发生发展等多种生命过程。 对于m7G RNA甲
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摘要：N1-甲基腺苷（N1-methyladenosine，m1A）是一种普遍存在于真核生物tRNA、rRNA和mRNA且可逆的转录后RNA修饰。基于高通量测序技术最新研究揭示m1A RNA修饰在基因调控和生物过程中的关键作用：对RNA稳定性和翻译起始等过程有着重要调节作用，广泛参与多种疾病的发生和发展。
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摘要：大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 植物内生菌中可培养的微生物种类十分有限,宏基因组学(metagenomics)是研究植物内生菌的有效手段之一。植物内生菌宏基因组研究通过不依赖于纯培养的宏基因组学(metagenomics)研究方法,构建植物内生菌的宏基因组文库,并从该
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摘要：大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 与常规RRBS不同，高通量单细胞甲基化测序sc-RBS由于从单个细胞输入的DNA量很少，常规方法不能保证目标DNA在最后的扩增过程中保持不变，因此sc-RBS在降损方面进行细化。易基因建立的高通量单细胞甲基化测序sc-RBS技术无需纯化，
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摘要：大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 原核转录组测序可以从基因表达量、基因结构和sRNA调控功能三维度揭示不同生物性状的分子调控机制。如通过计算各组间的差异基因并对差异基因进行富集分析，获得对生物性状影响较大的通路信息；通过预测基因的反义转录本，丰富基因组注释内容；研究sRN
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摘要：m6A是RNA上最丰富的一种修饰，平均每条转录本有1~3个m6A修饰。易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段（包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA），结合高通量测序，可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量，总RNA起始量可降低至10μg，最低仅
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摘要：大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 m5C是RNA百余种修饰中研究较多的一种。m5C存在于tRNA上时，可以对翻译进行调节；存在于rRNA上时，可以对核糖体的生物合成进行质控；存在于mRNA上时，则可以影响mRNA的结构、稳定性及翻译过程。 易基因提供适用于不同科研需求的m
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摘要：大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 对目标基因/CpG 位点甲基化检测，建立灵活的靶向甲基化测序技术。易基因建立的靶基因甲基化高通量测序（Target Bisulfite sequencing，Target-BS）是针对已有目标基因panel组合，运用易基因自主研发的甲基化
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摘要：大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 上次我们分享了：全基因组DNA甲基化实验怎么做：手把手教你做全基因组DNA甲基化测序分析，深受同学们的欢迎。 本期，易基因小编给您讲讲简化基因组DNA甲基化实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等三方面详细介绍。 一、简化基因
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摘要：本期，易基因小编给您讲讲染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和实验成功的关键问题等四方面详细介绍。 一、染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）技术原理 蛋白质与DNA相互识别是基因转录调控的关键,也是启动基因转录的前提。ChIP技术是在全基因组
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摘要：大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS)是利用限制性内切酶对基因组进行酶切，富集启动子及CpG岛等重要的表观调控区域并进行重亚硫酸盐测序该技术显著提高了高CpG区
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摘要：大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 羟甲基化5hmC是哺乳动物基因组上的第六碱基，在发育、衰老、神经退行性疾病、复杂疾病及肿瘤发生过程中起重要作用。DNA羟甲基化是近年发现的一种新的DNA修饰并迅速成为研究热点。随着研究的深入，发现之前被认为是检测DNA甲基化标准的重亚硫
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