Yusy's Blog

摘要： 优缺点浅评 Logseq是一款双链笔记软件，其优点结合使用场景概括来说包括 开箱即用的极简界面，非常适合用来写日报 灵活的双链，强大的PDF标注，适合构建文献库 使用markdown格式来本地存储笔记，随意备份 缺点 多端同步功能薄弱，我不知道有没有实现方法，反正很麻烦 没有了 然后就简单记录一下我 阅读全文

摘要： 绘制标准曲线 首先根据公式，计算出标准品曲线的x值（拷贝数），需要修改的数值是标准品质粒浓度（图上的321）和4565（基因片段长度），得出的结果单位是拷贝数/μl。 根据计算结果，可以列出表格，样品倍比稀释到-11稀释度时，拷贝数为0.27（取log），那么-10的时候，就是1.27，以此类推。 阅读全文

摘要： 数据准备 Teamviewer登录实验室服务器，访问http://172.17.128.86:8501/CleanData，按照页面对应的格式要求分别从NCBI和GISAID数据库下载数据，拖拽到对应的位置，点击GO即可。 Gisaid DNA Accession no.|DNA INSDC|Iso 阅读全文

摘要： 本文演示的是用Gisaid官网自带的Excel宏批量上传毒株信息和序列到Gisaid数据库，需要魔法。 1. 下载GISAID Batch Uploader 找到自己需要上传的病毒类型，我是Flu，在对应的选项卡下面找到Batch Upload，确认一下自己的Excel版本是否支持，然后点击右下角的 阅读全文

摘要： 搭建本地NCBI病毒库用于Blast 目的：为了通过Blast剔除我数据集中所有与Human任意片段相似度超过97%的序列 日期：2022/11/17 1. Nt库下载 创建conda环境 conda create -n aspera conda activate aspera conda inst 阅读全文

摘要： 系统环境为windows11 1. 下载blast程序 https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 双击安装，记住自己的安装目录 2. 在Bioaider里配置本地Blast程序路径 选择到bin目录，add即可，此时S 阅读全文