2025年2月19日
批量上传序列到Gisaid数据库
摘要： 本文演示的是用Gisaid官网自带的Excel宏批量上传毒株信息和序列到Gisaid数据库，需要魔法。 1. 下载GISAID Batch Uploader 找到自己需要上传的病毒类型，我是Flu，在对应的选项卡下面找到Batch Upload，确认一下自己的Excel版本是否支持，然后点击右下角的 阅读全文
posted @ 2025-02-19 19:50 鹿衔草_Yusy 阅读(192) 评论(0) 推荐(0)
搭建本地NCBI病毒库用于Blast
摘要： 搭建本地NCBI病毒库用于Blast 搭建本地NCBI病毒库用于Blast 目的：为了通过Blast剔除我数据集中所有与Human任意片段相似度超过97%的序列 日期：2022/11/17 1. Nt库下载 创建conda环境 conda create -n aspera conda activate aspera conda inst 阅读全文
posted @ 2025-02-19 19:47 鹿衔草_Yusy 阅读(83) 评论(0) 推荐(0)
使用Bioaider进行本地blast
摘要： 使用Bioaider进行本地blast 系统环境为windows11 1. 下载blast程序 https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 双击安装，记住自己的安装目录 2. 在Bioaider里配置本地Blast程序路径 选择到bin目录，add即可，此时S 阅读全文
posted @ 2025-02-19 19:43 鹿衔草_Yusy 阅读(397) 评论(0) 推荐(0)