摘要： 宏基因组 ( Metagenome)(也称微生物环境基因组 Microbial Environmental Genome, 或元基因组) 。是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词, 其定义为“the genomes of the total microbiota found in 阅读全文

摘要： Bioinformatics、BMC Bioinformatics 阅读全文

摘要： 使用过的命令： ../seqtk_concat out_1.fq out_2.fq | head -n 8 ../seqtk_concat out_1.fq out_2.fq > ../wgsim.fq #双端序列合并 seqtk_names wgsim.fq | cut -f1,2 -d'_'| 阅读全文

摘要： 文章链接：http://biorxiv.org/content/early/2016/10/15/081141 作者：Yee Voan Teo, Nicola Neretti 时间：2016.10.15 摘要： 许多宏基因组分类工具在宏基因组学领域增长速度飞速。然而，在这个领域相近物种的分类仍然是一 阅读全文

摘要： 问题描述：计算DNA中每种核苷酸的数目 输入文件内容： 代码： 输出结果： 阅读全文

摘要： kraken：是一个将分类标签打到短ＤＮＡreads上的分类序列器。 阅读全文

摘要： Near-optimal RNA-Seq quantification https://pachterlab.github.io/kallisto 输入输出文件说明：http://bio.math.berkeley.edu/eXpress/manual.html 文章标题： Pseudoalignm 阅读全文

摘要： Kaiju: Fast and sensitive taxonomic classification for metagenomics 问题描述：However, nucleotide comparison using a fixed k-mer length often lacks the sen 阅读全文

摘要： 在生信分析中经常会和贝叶斯打交道，比如贝叶斯分类器、贝叶斯网络、贝叶斯构建进化树等等。但是如果不清楚贝叶斯的原理，其实是很难对整个算法有深入了解的。这里小编整理了网络上的关于贝叶斯的最好的讲解，希望大家把它收藏起来，慢慢的啃。 前言 事实上，介绍贝叶斯定理、贝叶斯方法、贝叶斯推断的资料、书籍不少，比 阅读全文

摘要： 如何使用Bowtie2 相似功能的有： 创建索引 创建索引bowtie2-build使用的命令。 -f指定要索引文件后，再给予索引的名称。名称可以连接到任何。 阅读全文