2016 年 11月 17 日随笔档案 - Google-boy

2016年11月17日

摘要：在生信分析中经常会和贝叶斯打交道，比如贝叶斯分类器、贝叶斯网络、贝叶斯构建进化树等等。但是如果不清楚贝叶斯的原理，其实是很难对整个算法有深入了解的。这里小编整理了网络上的关于贝叶斯的最好的讲解，希望大家把它收藏起来，慢慢的啃。前言事实上，介绍贝叶斯定理、贝叶斯方法、贝叶斯推断的资料、书籍不少，比阅读全文

posted @ 2016-11-17 20:58 Google-boy 阅读(11609) 评论(0) 推荐(2)

Bowtie2

摘要：如何使用Bowtie2 相似功能的有：创建索引创建索引bowtie2-build使用的命令。 -f指定要索引文件后，再给予索引的名称。名称可以连接到任何。阅读全文

posted @ 2016-11-17 11:03 Google-boy 阅读(414) 评论(0) 推荐(0)

MetaPhlAn 2：宏基因组进化分析

摘要：描述 MetaPhlAn是分析从物种水平分辨率宏基因组鸟枪法测序数据的微生物群落（细菌，古细菌，真核细胞和病毒）的组成的计算工具。从版本2.0，MetaPhlAn还能够确定具体的菌株（在将样品含有先前测序的菌株的不那么频繁的情况下），并跟踪跨越样品菌株的所有物种。 MetaPhlAn 2依靠〜1M唯阅读全文

posted @ 2016-11-17 10:20 Google-boy 阅读(2950) 评论(0) 推荐(0)

常用序列模拟软件

摘要：常用的序列模拟软件 MetaSim软件manual:http://ab.inf.uni-tuebingen.de/software/metasim/welcome.html 阅读全文

posted @ 2016-11-17 09:04 Google-boy 阅读(365) 评论(0) 推荐(0)