BioMarkerInfo

摘要： HGVS，全称是Human Genome Variation Society，即人类基因组变异协会的缩写。它制定了一套规则，告诉人们如何描述一个变异，以便于学术交流和计算机识别。 在命名时，需要在DNA、RNA和蛋白质三个层面描述同一个变异，这充分体现了此命名法则对变异本身功能性体现的考虑。 DNA 阅读全文

摘要： 庐州月光 R语言绘图边框的单位 在R语言中指定画图边框时，通常使用两种单位， lines 和 inches 当然，这两个单位之间是可以相互转换的，那么 1 inch = ? line 答案是1 inches = 5 lines 下面给出具体的分析过程： par 函数中有两个参数，返回的是margin 阅读全文

摘要： R包ropls的偏最小二乘判别分析（PLS-DA）和正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA） Original 生信小白鱼 鲤小白 小白鱼的生统笔记 2020-01-08 收录于话题 #多变量的降维分析35 #聚类和分类23 R包ropls的PCA、PLS-DA和OPLS-DA在代谢组学分析中经常可 阅读全文

摘要： fastp -i R1.fq.gz -I R2.fq.gz -o R1.clean.fastq -O R2.clean.fastq --json fastp.json --html fastp.html --qualified_quality_phred 15 --unqualified_perce 阅读全文

摘要： 使用bash shell删除目录中的特定文件的3种方法 更新时间：2014年06月26日 13:09:32 投稿：junjie 这篇文章主要介绍了使用bash shell删除目录中的特定文件的3种方法,分别为扩展模式匹配符、GLOBIGNORE 变量和find 命令,需要的朋友可以参考下 我是一名L 阅读全文

摘要： finditer finditer( rule , target [,flag] ) 参数同findall 返回⼀个迭代器 finditer函数和findall函数的区别是，findall返回所有匹配的字符串，并存为⼀个列表，⽽ finditer则并不直接返回这些字符串，⽽是返回⼀个迭代器。关于迭代 阅读全文

摘要： Variant Call Format(VCF)是一个用于存储基因序列突变信息的文本格式。表示单碱基突变, 插入/缺失, 拷贝数变异和结构变异等。BCF格式文件是VCF格式的二进制文件。 CHROM [chromosome]: 染色体名称。 POS [position]: 参考基因组突变碱基位置，如 阅读全文

摘要： vcf文件（call variants得来的）怎么看变异是纯合还是杂合的 weixin_33830216 2017-06-25 18:15:00 270 收藏 1 版权 如下图片所示： 对于位置为48245131的allele来说，REF为A，ALT为C 想确定变异到底是纯合还是杂合，即两条染色体是 阅读全文

摘要： 阅读全文

摘要： R 绘图legend前面不要加+, plot()+legend是错误的. 阅读全文