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摘要： 用到R语言自带的mtcars数据集，首先我们把它转化成tibble形式，然后存放在mtcars1中。准备代码如下： library(tidyverse) mtcars %>% as_tibble() -> mtcars mtcars %>% group_by(cyl) %>% slice(1:3) 阅读全文

摘要： TCGA 数据下载分析利器 —— TCGAbiolinks（二）临床数据下载 名本无名 1 人赞同了该文章 获取临床信息 TCGAbiolinks 还提供了一些用于查询、下载和解析临床数据的函数，GDC 数据库中的包含多种不同的临床信息，主要包括： indexed clinical: 使用 XML  阅读全文

摘要： https://git-scm.com/book/zh/v2 4.4 服务器上的 Git - 配置服务器 配置服务器 我们来看看如何配置服务器端的 SSH 访问。 本例中，我们将使用 authorized_keys 方法来对用户进行认证。 同时我们假设你使用的操作系统是标准的 Linux 发行版，比 阅读全文

摘要： R中的apply族函数和多线程计算 龙君蛋君 2020-07-23 栏目: windows · 来源: 龙君蛋君 作者：龙君蛋君 简介 这篇文章主要介绍了R中的apply族函数和多线程计算以及相关的经验技巧，文章约6601字，浏览量234，点赞数4，值得参考！ 一.apply族函数 1.apply 阅读全文

摘要： Num01–>TCP通信模型 Test01–>TCP客户端案例 阅读全文

摘要： 原生態 蛋白组学定量值得比较说明 1. Maxquant的iBAQ和LFQ，该用哪个？我们使用Maxquant做Label Free蛋白质组学定量分析的时候，在Maxquant的参数设置时，会遇到两个参数，LFQ和iBAQ，那么，选择哪个好呢？如果你都选上，在最终的proteingroups.txt 阅读全文

摘要： 每个蛋白在每个组内的表达稳定性，就是它在这个组内有多少outlier值。 剔除outlier后p值算法： 1.针对某个蛋白把其在某个组的样本的表达值从小到大分为了4个部分，其中1/4处的值记为Q1，2/4处的值记为Q2，3/4处的值记为Q3；四分位距 IQR=Q3-Q1; 2.小于Q1-1.5(IQ 阅读全文

摘要： 生信宝典之前总结了一篇关于GSEA富集分析的推文——《GSEA富集分析 - 界面操作》，介绍了GSEA的定义、GSEA原理、GSEA分析、Leading-edge分析等，不太了解的朋友可以点击阅读先理解下概念 （下面摘录一部分）。 GSEA案例解析介绍GSEA分析之前，我们先看一篇Cell文章(ht 阅读全文

摘要： Illumina测序什么时候会测序到接头序列？ 生信宝典 2020-12-09 23:58:45 888 收藏 5文章标签： css html sms https js版权 什么是插入片段？在NGS基础 - 高通量测序原理中提到过文库的构建，具体如下图 图中黑色片段即为我们的插入片段。根据测序用途不 阅读全文

摘要： 循环肿瘤DNA，即 ctDNA（circulating tumor DNA），是指肿瘤细胞经外泌体、细胞坏死或凋亡释放进入循环系统中的DNA。ctDNA 可作为肿瘤生物标记物，我们通过检测血液中的 ctDNA，就能够追踪到肿瘤在血液中的踪迹。 目前ctDNA的分析方法主要有三种：以 ARMS 为代表 阅读全文