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摘要： 1.bwa的下载与安装 https://www.jianshu.com/p/19f58a07e6f4 主要参考这篇帖子，如果之前的步骤都走通了的话，依赖什么的不用特别安装，报错了再补也可以 安好了之后，进到他的路径，输./bwa,就可以确认bwa有没有安装好了，环境设置好以后可以在其他地方输入bwa 阅读全文

摘要： 1.FastQC分析检测报告 在先前的记录中，我们已经得到了我们的QC报告，现在要针对我们的报告对原始数据进行过滤 其中 和 都表明该数据需要去接头，并对序列进行处理 2.Trimmomatic的下载 首先，使用conda安装Trimmomatic conda install Trimmomatic 阅读全文

摘要： 从NCBI上下载下来的GBFF文件，使用python脚本可以转化为GFF文件 https://blog.csdn.net/weixin_42677653/article/details/116398985 这个脚本可以直接使用，将py脚本文件和你要处理的文件夹放一起，然后进入这个文件夹，输入：pyt 阅读全文

摘要： 1.FastQC的下载，安装 https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html#fastqc 在这里下ZIP包，这个是已经编译过的，打开设好路径就能用。 注意：FastQC使用之前记得安装好Java Developmen 阅读全文

摘要： 1.安装SRA Tools 通过SRA Toolkit可以方便的从NCBI下载SRA数据，但是速度较慢，Aspera虽然快，但是难点在于找NCBI的源文件地址，而且SRA Toolkit好像可以调用Aspera（虽然还没找到方法） 具体操作可以参考这个帖子，下载安装很容易，主要是配置环境要配置好，不 阅读全文

摘要： 如何从NCBI上下载数据——使用ASCP下载数据 1.下载ASCP https://cloud.tencent.com/developer/article/2368150 2.获取NCBI上的ACCESSION IDs ①.在NCBI-SRA上检索自己想要数据。 ②.拉到最底下，选择send to 阅读全文