摘要：错误： KeyError: 'INCLUDE' 使编译出错 解决方法： [usrname@host source]$ vim tools/build/site.settings 注释# "include_path" : os.environ["INCLUDE"].split(":"), 行 问题解决 阅读全文
显示python已安装模块及路径，添加修改模块搜索路径
2016-11-15 09:41 by 丨o聽乄雨o丨, 807 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：在python交互模式下输入： help(‘modules’) #可以显示出已安装的模块 在python交互模式下输入: import sys sys.path #可以显示出模块搜索路径 增加搜索路径的方法： 一、 sys.path.append() #此方法仅临时修改搜索路径，程序运行完成即结束 阅读全文
sort
2016-09-07 16:47 by 丨o聽乄雨o丨, 153 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：sort -n -k2 filename 按第二列，按顺序排列 sort -nr -k2 filename 按第二列，按反向顺序排列 阅读全文
python os 命令，及判断文件夹是否存在
2016-08-24 16:55 by 丨o聽乄雨o丨, 44788 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：使用前 import os导入模块 os模块： os.sep 可以取代操作系统特定的路径分割符 os.linesep 字符串给出当前平台使用的行终止符。例如，Windows使用'\r\n'，Linux使用'\n' 而Mac使用'\r'。 os.name 字符串指示你正在使用的平台。比如对于Windo 阅读全文
linux 查看磁盘剩余命令
2016-06-08 09:53 by 丨o聽乄雨o丨, 478 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：1 df -hl 命令查看各磁盘的大小，使用情况，挂载点等信息。 1 du -bs dir_name 查看具体目录的空间大小 1 du -bsh * 以人类可读的格式，查看当前目录各文件夹及文件大小 阅读全文
cat hesA/Models/score_tgt.sc| awk '{ print $2,$19}' | sort -n -k 1
2016-05-12 13:06 by 丨o聽乄雨o丨, 160 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：cat hesA/Models/score_tgt.sc| awk '{ print $2,$19}' | sort -n -k 1 print the second collum in order 阅读全文
fasta文件拆分与合并
2016-03-23 12:29 by 丨o聽乄雨o丨, 7016 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：FASTA文件的拆分： （1）如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b： （2）将某一文件a中每一条序列保存到一个文件中： FASTA文件合并： 阅读全文
install MCR in silent mode linux server
2016-01-21 10:10 by 丨o聽乄雨o丨, 324 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：./install -mode silent -agreeToLicense yes -destinationFolder /home/yanzhh/wq/Programs/MCRexport LD_LIBRARY_PATH=$Programs/MATLAB/MATLAB_Runtime/v717/... 阅读全文
cat *.txt | grep '>' | wc -l
2016-01-12 14:10 by 丨o聽乄雨o丨, 699 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：find the line where the '>' located, and make a statistic. 阅读全文
rosetta common sh: mpiCC command not found解决方法
2016-01-07 16:25 by 丨o聽乄雨o丨, 4697 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：在执行多线程编译rosetta时执行: python scons.py bin mode=release extras=mpi -j8 编译安装rosetta 会出现错误sh: mpiCC command not found导致编译终止。 解决方法： 1.首先确定已安装openmpi，不管你是安到/ 阅读全文