摘要：
f"{sid}_KP_{sample_ids.index(sid)+1}" 是 Python 的格式化字符串写法，叫做 f-string（full name: formatted string literals），是 Python 3.6+ 引入的一种 更简洁高效的字符串拼接方式。 ✅ 一、这段代码 阅读全文
posted @ 2025-05-21 22:24
tomorgen
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摘要：
Python 中 查看和探索对象（如 DataFrame、AnnData、Numpy 数组、自定义类等） 的 常用方法汇总，这对调试和数据理解非常重要： ✅ Python 查看对象的常用方法汇总 🔹 1. 通用对象检查（适用于任何 Python 对象） 命令 说明 type(obj) 查看对象类型 阅读全文
posted @ 2025-05-21 13:06
tomorgen
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摘要：
在 Linux 终端 获取帮助或查看命令/函数用法，可以用以下几种标准方式： ✅ 常见命令帮助方式总结 1. --help 选项 适合大多数命令查看简要说明和用法。 <命令> --help 示例： ls --help grep --help 2. man 手册 查看完整详细的手册页。 man <命令 阅读全文
posted @ 2025-05-20 16:17
tomorgen
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摘要：
你执行的 dir(adata1) 显示了 AnnData 对象（多用于单细胞转录组分析，来自 scanpy 库）的全部属性和方法。 为了方便你理解和日后查阅，下面是对 AnnData 中常见字段和方法的中文解释与归类整理： ✅ AnnData（如 adata1）对象常用属性及方法详解（中文注释版） 阅读全文
posted @ 2025-05-20 09:45
tomorgen
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摘要：
你现在已经激活了一个 Conda 环境： conda activate /data/home/ch_seq/env_py38 那么你不需要新建一个环境，可以直接在这个环境里安装需要的包。不过你仍然可以生成一个 environment.yml 文件，用来记录你这个环境所使用的依赖，以便以后： 快速重建 阅读全文
posted @ 2025-05-19 23:39
tomorgen
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摘要：
下面是对 nano 文本编辑器的基本使用方法的详细讲解，适用于 Linux 和 macOS 系统终端中常见的 nano 命令行编辑器。 📘 一、什么是 nano nano 是一个简单易用的命令行文本编辑器，适用于快速编辑配置文件、代码、文本等。它是 vi 或 vim 的简化替代方案，对新手尤其友好 阅读全文
posted @ 2025-05-19 23:21
tomorgen
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摘要：
🧾 Linux 生信方向综合测评手册标准答案与评分标准 ✅ A 卷参考答案 📘 一、选择题（每题 2 分，共 20 分） 题号 题目内容简述 正确答案 解析简述 1 vim中保存并退出 :wq :wq 表示写入并退出 2 cd ~ 含义 回到家目录 ~ 是 home 目录的快捷方式 3 显示当前 阅读全文
posted @ 2025-05-19 18:13
tomorgen
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🧪 Linux 生信方向综合测试题 测试目的： 巩固知识，检验理解与实战能力。 题型覆盖： 基础命令、文件操作、conda环境、shell流程控制、脚本编程、正则表达式、文本处理。 📘 一、选择题（共10题，每题2分） 1. 以下哪条命令可用于创建空文件？ A. create file.txt 阅读全文
posted @ 2025-05-19 18:12
tomorgen
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摘要：
🐧 Linux 基础操作与文件处理笔记（生信方向） 一、课程综述与目标 本课程面向生信初学者，从零基础开始，通过在 Linux 系统上的命令行操作，逐步掌握对数据文件的基本管理能力，并为转录组等高通量组学项目做准备。 📌 课程目标 掌握 Linux 基本命令与文件管理操作； 熟悉终端登录、文件系 阅读全文
posted @ 2025-05-19 15:54
tomorgen
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🌟单细胞分析框架概览（总） 单细胞组学是当前生命科学研究中的热点领域，随着技术发展，分析工具生态也日趋完善。当前主流的单细胞分析框架主要分为三大阵营： 框架 语言 代表生态 Bioconductor R 多种包：SingleCellExperiment、scran 等 Seurat R Seura 阅读全文
posted @ 2025-05-19 11:28
tomorgen
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