随笔分类 - lammps学习
data、input
摘要：（摘自以下内容） 下边我们做几组测试，并对比计算速度：（采用同一个模型，所含原子数：19144（算挺得多了），所用服务器总核数仅为40个核，当前还剩下16个核的空间（已用24个核）） 4个核——未超负荷运行100%情况下——1天能跑0.488 ns=488 ps 26个核——超负荷10个核运行——1
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摘要：LAMMPS之约束方法（转摘）：https://mp.weixin.qq.com/s/xvNgzzbpfRfOludj1BZjuQ
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摘要：1.安装：自己去Sublime Text官网下载安装包，自行安装即可。https://onebox.mydown.com/soft/41/473305041.shtml?f=360box_65490 2.安装之后，脚本中如何显示中文？ 安装后，一开始可能不能识别中文，需要我们自己设置，可参考：htt
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摘要：一、参考资料： 1. lammps已跑完，不想重跑，如何补充新的计算 （来自小马老师，https://mp.weixin.qq.com/s/pDWaxcdq75hmMOdbG9hSNQ ） 2.lammps通过rerun进行rdf分析，来自： https://zhuanlan.zhihu.com/p
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摘要：1.摘自：https://jerkwin.github.io/2016/12/31/GROMACS%E5%92%8CVMD%E4%B8%AD%E7%9A%84%E6%B0%A2%E9%94%AE%E5%88%A4%E5%AE%9A%E6%A0%87%E5%87%86/ https://mp.weix
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摘要：单位换算链接：https://jerkwin.github.io/gmxtools/calc/calc.html 1.能量 表面能单位换算： 1ev = 23.0605 Kcal/mol = 1.602176634e-19 J = 1.602176634e-16 mJ 1ev/A2 = 23.060
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摘要：转摘自小马老师的微信公众号：https://mp.weixin.qq.com/s/QgPDGHse42dM1y9XbGj-Ag 本文介绍lammps输出模拟结果的4种方式。 lammps模拟的数据从数据结构上分，大体可以分为两类：标量和矢量。 标量是一个值，类似C语言中的一个普通变量，通常表示全局或
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摘要：转摘自：https://mp.weixin.qq.com/s/-KtQq7YqtyZFakRePot86Q，https://www.biolinscientific.com/blog/what-is-the-difference-between-surface-and-interfacial-ten
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摘要：讨论1. What is the work of adhesion？ （转摘自：https://www.biolinscientific.com/blog/work-of-adhesion-what-is-it-and-how-to-measure-it） a.定义：粘附功W12是指从相邻两相1和2
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摘要：1. 界面能、界面张力 （转摘自：https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%A1%A8%E9%9D%A2%E8%83%BD） （该算法来自文献：Computer simulation of polyolefin interfaces，1999）
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摘要：能量-力之间的关系：能量对位移的求导就等于力。
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摘要：转摘自知乎：https://zhuanlan.zhihu.com/p/359014805?utm_medium=social&utm_oi=869273158199443456。这个解释很清晰，帮助理解。 一、广义胡克定律 材料在线弹性范围内，应力 与应变 成正。由于一些剪切条件的等价性和对称性，对
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摘要：摘自：https://mp.weixin.qq.com/s/kJ1aNa77BLi4EdthEYVJSg （小马老师） 在lammps模拟中，有“刚体”和“固定”的设置，在平时咨询过程中，发现还有小伙伴对两者的区别分不大清楚。 在设置”刚体“的时候使用固定的命令，反之也有。 ”刚体“和”固定“的设置
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摘要：摘自：https://mp.weixin.qq.com/s/9AXfK4pttzhwZ3H7U-JIgw （小马老师） 本文介绍lammps in文件编写过程中一个常见的错误：重复积分。 分子动力学模拟的主要运算是原子的积分运算，通过求解积分方程得到原子的受力以及计算原子的速度，从而得出下一时刻原子
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摘要：摘自：https://mp.weixin.qq.com/s/qFQC7ZQJWGou9wD9WkziAQ 本文继续介绍lammps基本操作命令。 在lammps模拟中，所有的原子处在一个封闭的空间内，这个空间称为盒子（box）。 创建box有两种方法，一是在lammps中使用create_box命令
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摘要：问题：在MS软件导出car、mdf文件后，因为通过lammps的msi2lmp.exe所导出来的data文件，原子序号不按照我们所想要排列的顺序，如何修改？ 方法： 1.先打开car、mdf文件 2.直接通过复制、粘贴的方式，将想要排在最前边的原子的信息放在前边即可。
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摘要：https://blog.csdn.net/this_capslock/article/details/17415409
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摘要：1.安装： 官网下载：https://atomsk.univ-lille.fr/dl.php 2.cmd如何打开：按住“菜单”+R，再输入cmd，即可打开； 3.cd 进入装有Atomsk的文件夹，输入atomsk的相关命令即可。 学习资料： 1.b站视频：https://www.bilibili.
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摘要：转自：https://www.cnblogs.com/Simulation-Campus/p/8823291.html 1 electron-volt [eV] = 11604.5250061657 kelvin [K] https://www.translatorscafe.com/unit-co
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