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S_梦痕
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2023年7月8日
Debian 12安装phpMyAdmin记录
摘要: > 使用`apt install phpmyadmin`总会报错`AH01071: Got error 'PHP message: PHP Fatal error: Uncaught Error: Call to undefined function Symfony\\Component\\Depe
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posted @ 2023-07-08 01:21 S_梦痕
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2023年7月7日
Debian 12安装配置Apache2.4 + PHP8.0 + MySQL5.7常见问题记录
摘要: #### 1. Apache2.4 安装 #### 1.1 浏览器访问提示502错误 > 正常通过`sudo apt install apache2`安装,安装完成通过`systemctl status apache2`查看运行状态正常,但浏览器访问IP地址提示502错误 **解决:**问题大概率出
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posted @ 2023-07-07 15:54 S_梦痕
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Ubuntu 22.04(阿里云服务器)安装配置Apache2.4 + PHP8.0 + MySQL5.7
摘要: #### 1 安装Apache2.4 ```shell # Apache在Ubuntu中的名称为Apache2 # 更新apt sudo apt update # 安装apache2 sudo apt install apache2 ``` 
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2022年9月5日
php8.0源码编译安装mysqli拓展
摘要: 将开发环境web项目上传到CentOS8.0云服务器上后,调用PHP文件报500错误,经排查php环境中不存在mysqli拓展,导致无法使用mysqli_connect()函数;查看phpinfo()页面证实猜想;原因可能是yum安装PHP时默认无mysqli.so文件; 1 查看本地安装的php版
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posted @ 2022-09-05 18:12 S_梦痕
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2022年7月1日
MAC中借助docker将阿里云盘挂载到本地
摘要: Mac 空间太小,使用云盘客户端又有诸多不便,因此可以通过一些操作将阿里云盘挂载到本地;感谢大佬zx5253开源项目webdav-aliyundriver,目前虽然不再开源,但docker中尚有该项目的备份,因此可以继续使用【目前该镜像貌似已经挂掉了,若不能使用,可以使用备用镜像】; 1 使用工具
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posted @ 2022-07-01 01:44 S_梦痕
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2022年5月19日
慢病毒包装原理解析
摘要: 1 慢病毒简介 慢病毒(Lentivirus)属是反转录病毒科(Retrovirus)下的一个属,病毒含有RNA-DNA聚合酶(RNA-directed DNA polymerase)亦即反转录酶(retrotranscriptase)做为复制之用。 2 慢病毒载体 慢病毒载体是以HIV-1
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posted @ 2022-05-19 16:15 S_梦痕
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2022年4月4日
Samtools报错解决方案【samtools: error while loading shared libraries: libbz2.so.1.0: cannot open shared object file: No such file or directory】
摘要: 辣鸡conda,总莫名其妙整出一些事故;之前在其他环境安装过Samtools,可以正常使用,但新建虚拟环境后重新安装,报以上错误; 报错原因:未找到库文件libbz2.so.1.0;怀疑是conda安装samtools是跳过了这个库的安装【查看之前可以正常使用的samtools版本,和现在安装的版本
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posted @ 2022-04-04 13:39 S_梦痕
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2022年2月22日
5.基因组索引文件创建—STAR
摘要: 1.脚本 1 #!/bin/bash 2 #使用star软件创建人类hg38基因组索引 3 4 fa_dir="/home/shenqingsong/project/RNA-Seq/reference/hg38/hg38.fa" 5 gtf_dir="/home/shenqingsong/proje
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posted @ 2022-02-22 20:41 S_梦痕
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2022年2月21日
4.数据质控、清洗、去接头
摘要: 使用sratoolkit的fastq-dump命令转换后得到的fastq文件可以接着使用fastqc和multiqc进行质控,fastq可以对数据出具HTML报告,multiqc可以将不同数据样本的HTML报告进行整合成一个总的HTML文件,便于查看测序数据的质量; 1.对数据进行质控分析 1 #!
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posted @ 2022-02-21 17:35 S_梦痕
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数据清洗—【trim_galore】那些事
摘要: Trim Galore是对FastQC和cutadapt的包装。适用于所有高通量测序,包括RRBS(Reduced Representation Bisulfite-Seq )、 Illumina、Nextera和smallRNA测序平台的双端和单端数据。主要功能包括两步:第一步首先去除低质量碱基,
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posted @ 2022-02-21 17:03 S_梦痕
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