S_梦痕

摘要： 使用sratoolkit的fastq-dump命令转换后得到的fastq文件可以接着使用fastqc和multiqc进行质控，fastq可以对数据出具HTML报告，multiqc可以将不同数据样本的HTML报告进行整合成一个总的HTML文件，便于查看测序数据的质量； 1.对数据进行质控分析 1 #! 阅读全文

摘要： Trim Galore是对FastQC和cutadapt的包装。适用于所有高通量测序，包括RRBS(Reduced Representation Bisulfite-Seq )、 Illumina、Nextera和smallRNA测序平台的双端和单端数据。主要功能包括两步：第一步首先去除低质量碱基， 阅读全文