博客目录 Blog directory

Linux 学习笔记

　   Linux 常用命令 -- Linux command lines

　   Linux ssh 免密登陆/快捷登陆 --SSH password-free login / quick login

Linux/Mac 挂载远程服务器目录到本地 --Mount remote server directory to local PC

远程连接服务器端Jupyter Notebook --Remote connection to server-side Jupyter Notebook

Linux Screen 命令（创建作业/分屏）--Linux Screen command

Linux 下上传代码到Github --Linux uploads code to Github

在 Git Bash 下使用 conda 命令 --Windows uses the conda command under git bash

 

Deep Learning

图像数据增强 Data Augmentation --Data Augmentation in Computer Vision

torchvision 批量可视化图片 --Batch Visualization of Images using torchvision

nn.Conv2d 参数及输入输出详解 --Detailed Description of nn.Conv2d Parameters

Keras Con1d 参数及输入输出详解 --Detailed Description of Keras Conv1d Parameters

Keras 实现 Self-Attention -- Keras implementation of Self-Attention

 

Python 学习笔记

　　 Python中 list, numpy.array, torch.Tensor 格式相互转化  --List, numpy.array, torch.Tensor formats in Python

　　Python写入训练日志文件并在控制台输出 --Python writes the training log file

　　Python Multiprocessing 多进程，并用tqdm显示进度条 --Python Multiprocessing and progress bar with tqdm

　　Python 使用 docopt 解析 json 参数文件 -- Python parses the json parameter file with docopt

　　Python sorted 函数用法 --Python sorted function usage

　　Python 中 plt 画柱状图和折线图 --Plt draws a histogram and a line chart in Python

 

环境搭建

　 Anaconda 查看、创建、管理环境  -- Anaconda View, create, manage the environment

　　Anaconda 安装第三方库遇到 PackageNotFoundError: "Package missing in current channel" 完美解决

 

Bioinformatics 学习笔记

　　使用cd-hit对蛋白质或核酸序列进行聚类 -- Clustering of protein or nucleic acid sequences using cd-hit

　　使用Aspera (ascp 命令) 从NCBI高速下载数据 -- Use aspera (ASCP command) to download data from NCBI