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posted @ 2019-04-10 20:17 SiyuanChen 阅读(111) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 免密登陆 假设电脑A需要免密登陆电脑B 1. 首先A机,本地需要生成 ~/.ssh 路径, ssh-keygen 2. 创建私钥,公钥 cd ~/.ssh id_rsa (私钥) id_rsa.pub (公钥) 3. A机上传公钥到B机 ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa 阅读全文
posted @ 2021-02-01 23:14 SiyuanChen 阅读(233) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 文件复制命令 cp 将源文件名移动至目标文件夹 cp [options] source_file destination_folder 2. 移动文件命令 mv 将源文件名改为目标文件名 mv [options] source_file new_file 将文件移动到目标目录 mv [opti 阅读全文
posted @ 2020-07-26 17:51 SiyuanChen 阅读(208) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 简介 生物信息研究人员往往需要从NCBI/sra 或者EBI/ENA下载高通量的测序数据。而通过NCBI申请获得的数据往往需要通过Aspeara进行下载。 2. Aspeara 安装 $ wget http://d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net/connect/bin 阅读全文
posted @ 2020-07-23 17:40 SiyuanChen 阅读(3288) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 我们在开发过程中总是需要借助第三方库,而通常第三方库都会通过anaconda环境安装,有时在安装过程中会遇到如下问题: 使用命令: conda install package_name 报错: PackageNotFoundError: Packages missing in current cha 阅读全文
posted @ 2020-06-21 15:25 SiyuanChen 阅读(3754) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 查看Python环境 conda info --env可以看到所有python环境,前面有个‘*’的代表当前环境: 2.创建Python环境 conda create -n enviornment_name python=3.6 代表创建一个python3.6的环境,我们把它命名为python 阅读全文
posted @ 2019-08-18 18:42 SiyuanChen 阅读(7483) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 背景 Python在一些数据可视化的过程中需要使用 plt 函数画柱状图和折线图。 2. 导入 3. 柱状图 4.折线图 5.保存 阅读全文
posted @ 2019-08-18 18:26 SiyuanChen 阅读(9557) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本文转载自:https://blog.csdn.net/xiaosongshine/article/details/90600028 一、Self-Attention概念详解 对于self-attention来讲,Q(Query), K(Key), V(Value)三个矩阵均来自同一输入,首先我们要 阅读全文
posted @ 2019-08-13 20:50 SiyuanChen 阅读(4448) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1.背景 在python中,通常需要使用排序函数。而对字典针对一个键值进行排序会经常使用到。记录sorted 函数的键值排序用法。 2.代码 data 一个list,list 中的元素由字典组成 如果需要对每个字典中的rate值进行从低到高排序,代码如下: 阅读全文
posted @ 2019-08-12 22:48 SiyuanChen 阅读(236) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转载自:https://huifangliu.github.io/2018/08/22/%E4%BD%BF%E7%94%A8cd-hit%E5%AF%B9%E8%9B%8B%E7%99%BD%E8%B4%A8%E6%88%96%E6%A0%B8%E9%85%B8%E5%BA%8F%E5%88%97% 阅读全文
posted @ 2019-08-06 23:15 SiyuanChen 阅读(643) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 背景 在深度学习的任务中,通常需要比较复杂的参数以及输入输出配置,比如需要不同的训练data,不同的模型,写入不同的log文件,输出到不同的文件夹以免混淆输出 常用的parser.add()方法非常占用代码空间,而且输入输出配置无法通过文件更改,只能通过命令行参数改变。 docopt 库提供了 阅读全文
posted @ 2019-08-06 22:03 SiyuanChen 阅读(455) 评论(0) 推荐(0) 编辑